AutoDock: Różnice pomiędzy wersjami
| Linia 1: | Linia 1: | ||
| − | <small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]]</small> | + | <small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < AutoDock</small> |
| − | {{aplikacja|nazwa=AutoDock|logo=|serwer=[[Supernova]]|wersja=4.2.3 |składowe=Programy |lista=AutoDock, AutoGrid}} | + | {{aplikacja|nazwa=AutoDock|logo=[[Plik:Autodock_logo.gif|200px]]|serwer=[[Supernova]]|wersja=4.2.3 |składowe=Programy |lista=AutoDock, AutoGrid}} |
'''AutoDock''' - aplikacja służąca do przewidywania sposobu wiązania się ligandów do receptora o znanej strukturze przestrzennej. | '''AutoDock''' - aplikacja służąca do przewidywania sposobu wiązania się ligandów do receptora o znanej strukturze przestrzennej. | ||
| − | Pakiet udostępniany jest na wolnej licencji GNU GPL | + | == Liencja == |
| + | Pakiet udostępniany jest na wolnej licencji GNU GPL. | ||
| − | == Korzystanie | + | === Informacje o wykorzystaniu === |
| + | {{Podziękowanie WCSS}} | ||
| + | |||
| + | == Korzystanie w WCSS== | ||
AutoDock jest aplikacją sekwencyjną. | AutoDock jest aplikacją sekwencyjną. | ||
Wersja z 13:02, 20 lip 2012
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < AutoDock
| AutoDock | |
|---|---|
| |
| Serwer | Wersja |
| Supernova | 4.2.3 |
| Programy | |
| AutoDock, AutoGrid | |
| Kontakt | |
| kdm@wcss.pl | |
AutoDock - aplikacja służąca do przewidywania sposobu wiązania się ligandów do receptora o znanej strukturze przestrzennej.
Liencja
Pakiet udostępniany jest na wolnej licencji GNU GPL.
Informacje o wykorzystaniu
Wszelkie publikacje, (w tym prace doktorskie i dyplomowe) wykorzystujące wyniki obliczeń wykonanych na komputerach WCSS, powinny zawierać podziękowania postaci (odpowiednio do języka publikacji):
"Obliczenia wykonano na komputerach Wrocławskiego Centrum Sieciowo-Superkomputerowego (http://www.wcss.pl), grant obliczeniowy Nr ... "
"Calculations have been carried out in Wroclaw Centre for Networking and Supercomputing (http://www.wcss.pl), grant No. ..."
Korzystanie w WCSS
AutoDock jest aplikacją sekwencyjną.
Obliczenia uruchamia się poleceniem:
> sub-autogrid <plik.gpf> [kolejka] > sub-autodock <plik.dpf> [kolejka]
np.
> sub-autogrid test.gpf normal > sub-autodock test.dpf normal
Dokumentacja
Zobacz też:
- Oprogramowanie KDM
- System kolejkowy PBS
| Oprogramowanie naukowe |
Abaqus ⋅ ABINIT ⋅ ADF ⋅ Amber ⋅ ANSYS [ ANSYS CFD: Fluent, CFX, ICEM; Mechanical ] ⋅ AutoDock ⋅ BAGEL ⋅ Beast ⋅ Biovia [ Materials Studio, Discovery Studio ] ⋅ Cfour ⋅ Comsol ⋅ CP2K ⋅ CPMD ⋅ CRYSTAL ⋅ Dalton ⋅ Dask ⋅ DIRAC ⋅ FDS-SMV ⋅ GAMESS ⋅ Gaussian ⋅ Gromacs ⋅ IDL ⋅ Lumerical [ FDTD, MODE ] ⋅ Mathcad ⋅ Mathematica⋅ Matlab ⋅ Molcas ⋅ Molden ⋅ Molpro ⋅ MOPAC ⋅ NAMD ⋅ NBO ⋅ NWChem ⋅ OpenFOAM ⋅ OpenMolcas ⋅ Orca ⋅ Quantum ESPRESSO ⋅ R ⋅ Rosetta ⋅ SIESTA ⋅ Tinker ⋅ TURBOMOLE ⋅ VASP ⋅ VMD ⋅ WIEN2k |
|---|