Bem: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Skocz do: nawigacji, wyszukiwania
(Parametry klastra)
Linia 6: Linia 6:
 
|admini=kdm@wcss.pl
 
|admini=kdm@wcss.pl
 
}}
 
}}
'''Bem''' - klaster zainstalowany w [[WCSS]] w marcu 2015 r. Architektura wszystkich komputerów to x86_64 z procesorami Intel Xeon E5-2670v3 (mikroarchitektura Haswell).
+
'''Bem''' - klaster zainstalowany w [[WCSS]] w marcu 2015 r. Architektura wszystkich komputerów to x86_64 z procesorami Intel Xeon (mikroarchitektura Haswell).
  
 
=== Parametry klastra ===
 
=== Parametry klastra ===
  
* węzeł dostępowy: '''bem.wcss.pl''',
+
* węzeł dostępowy dla użytkowników lokalnych KDM WCSS: '''bem.wcss.pl''',
 +
* węzeł dostępowy dla użytkowników PL-Grid: '''ui.wcss.pl''',
 
* 688 węzłów obliczeniowych 24-rdzeniowych z 64 GB pamięci oper. (Intel Xeon E5-2670 v3 2.3 GHz, Haswell),
 
* 688 węzłów obliczeniowych 24-rdzeniowych z 64 GB pamięci oper. (Intel Xeon E5-2670 v3 2.3 GHz, Haswell),
 
* 32 węzły obliczeniowe 24-rdzeniowe ze 128 GB pamięci oper. (Intel Xeon E5-2670 v3 2.3 GHz, Haswell),
 
* 32 węzły obliczeniowe 24-rdzeniowe ze 128 GB pamięci oper. (Intel Xeon E5-2670 v3 2.3 GHz, Haswell),
Linia 17: Linia 18:
 
* 22 656 rdzeni obliczeniowych,
 
* 22 656 rdzeni obliczeniowych,
 
* 74,6 TB pamięci RAM,
 
* 74,6 TB pamięci RAM,
* przestrzeń na katalogi domowe użytkowników: 11 TB NFS /home,  
+
* przestrzeń na katalogi domowe użytkowników: 50 TB NFS,
 
* przestrzeń tymczasowa: 1,1 PB Lustre,
 
* przestrzeń tymczasowa: 1,1 PB Lustre,
 
* sieć obliczeniowa: Infiniband FDR, przepływność 56 Gbps (topologia fat-tree, współczynnik blokowania 3:1),
 
* sieć obliczeniowa: Infiniband FDR, przepływność 56 Gbps (topologia fat-tree, współczynnik blokowania 3:1),
 
* sieć zarządzania: Ethernet 1G/10G,
 
* sieć zarządzania: Ethernet 1G/10G,
* system operacyjny: CentOS 6.8,
+
* system operacyjny: Linux CentOS 6,
 
* moc obliczeniowa: 860 TFLOPS.
 
* moc obliczeniowa: 860 TFLOPS.
  

Wersja z 12:36, 9 sty 2018

< Podręcznik użytkownika KDM < Maszyny obliczeniowe < Bem

Bem
noframe
Kontakt
kdm@wcss.pl

Bem - klaster zainstalowany w WCSS w marcu 2015 r. Architektura wszystkich komputerów to x86_64 z procesorami Intel Xeon (mikroarchitektura Haswell).

Parametry klastra

  • węzeł dostępowy dla użytkowników lokalnych KDM WCSS: bem.wcss.pl,
  • węzeł dostępowy dla użytkowników PL-Grid: ui.wcss.pl,
  • 688 węzłów obliczeniowych 24-rdzeniowych z 64 GB pamięci oper. (Intel Xeon E5-2670 v3 2.3 GHz, Haswell),
  • 32 węzły obliczeniowe 24-rdzeniowe ze 128 GB pamięci oper. (Intel Xeon E5-2670 v3 2.3 GHz, Haswell),
  • 182 węzły obliczeniowe 28-rdzeniowe ze 128 GB pamięci oper. (Intel Xeon E5-2697 v3 2.6 GHz, Haswell),
  • 10 węzłów obliczeniowych 28-rdzeniowych z 512 GB pamięci oper. (Intel Xeon E5-2697 v3 2.6 GHz, Haswell),
  • 22 656 rdzeni obliczeniowych,
  • 74,6 TB pamięci RAM,
  • przestrzeń na katalogi domowe użytkowników: 50 TB NFS,
  • przestrzeń tymczasowa: 1,1 PB Lustre,
  • sieć obliczeniowa: Infiniband FDR, przepływność 56 Gbps (topologia fat-tree, współczynnik blokowania 3:1),
  • sieć zarządzania: Ethernet 1G/10G,
  • system operacyjny: Linux CentOS 6,
  • moc obliczeniowa: 860 TFLOPS.

Oprogramowanie

Aplikacje

Abaqus, ABINIT, ADF, Amber, ANSYS CFX, ANSYS Fluent, Cfour, Comsol, CP2K, CPMD, CRYSTAL09, Dalton, FDS-SMV, GAMESS, Gaussian, Gromacs, LAMMPS, LumericalFDTD, MODE ], Mathematica, Matlab, Molcas, Molpro, NWChem, Orca, R, Siesta, TURBOMOLE i inne oraz aplikacje własne użytkowników.

Kompilatory

GNU GCC, Intel, PGI i inne.

Biblioteki i narzędzia
  • OpenMPI,
  • HDF, HDF5,
  • NetCDF,
  • Python + SciPy + NumPy,
  • pozostałe.
System kolejkowania

PBSPro.

Zalecenia

  • na dysku /home wprowadzone zostały kwoty dyskowe: limit 50GB; sprawdzenie stanu:
quota

opis systemu kwot:

man quota

Zobacz też