CASTEP
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
The printable version is no longer supported and may have rendering errors. Please update your browser bookmarks and please use the default browser print function instead.
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie naukowe < Accelrys < Materials Studio
|
CASTEP jest dostępny na Leo w ramach pakietu Materials Studio 4.0 i licencji krajowej POLAND COUNTRYWIDE LICENSE.
Przykladowe uruchomienie zadania wsadowego w programie CASTEP. Skrypt zostal wygenerowany automatycznie przy użyciu klienta windows. Pliki z danymi zostały umieszczone w katalogu /scratch/$USER/zadanie1 .
#!/bin/sh -f if [ -f /usr/local/Accelrys/MaterialsStudio4.0/share/license/data/lic_setup.sh ]; then eval `/usr/local/Accelrys/MaterialsStudio4.0/share/license/data/lic_setup.sh \ /usr/local/Accelrys/MaterialsStudio4.0/ -s sh` fi if [ -f /usr/local/Accelrys/MaterialsStudio4.0/share/bin/ms_setup.sh ]; then eval `/usr/local/Accelrys/MaterialsStudio4.0/share/bin/ms_setup.sh \ /usr/local/Accelrys/MaterialsStudio4.0/ -s sh` fi JOB_SCRATCH=/scratch/$USER/zadanie1 PBS_TMPDIR="$TMPDIR" TMPDIR="$JOB_SCRATCH/tmp" export PBS_TMPDIR TMPDIR cd $JOB_SCRATCH mkdir -p $TMPDIR /usr/local/Accelrys/MaterialsStudio4.0/CASTEP/bin/castepexe.exe zadanie1 2> std_err.txt
Skrypt nalezy zapisac w pliku (np. skrypt.sh) i wstawić do kolejki poleceniem
qsub -V -N ''nazwa_zadania'' -q ''nazwa_kolejki'' skrypt.sh
Pliki wejsciowe, czyli zadanie1.cell oraz zadanie1.param nalezy umiescic w katalogu /scratch/$USER/zadanie1 Zadania z pakietu Accelrys nalezy wstawiac na Leo do kolejki accelrys