Cerius2: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
m (1 wersja: A-G)
 
Linia 3: Linia 3:
 
'''Cerius<sup>2</sup>''' - oprogramowanie chemiczne firmy [[Accelrys]].
 
'''Cerius<sup>2</sup>''' - oprogramowanie chemiczne firmy [[Accelrys]].
  
Razem z pakietem [[Insight II]] przeznaczony do szeroko rozumianego modelowania molekularnego w środowisku 3D. Składa się ze zintegrowanego środowiska użytkownika oraz modułów pozwalających na modelowanie, modyfikowanie, wizualizację i analizę dużych układów biomolekularnych (np. białek, kwasów nukleinowych) oraz chemii i fizyki nowych materiałów, od modelowania homologii do projektowania katalizatorów. Dostępne tylko dla platformy SGI z możliowścią pracy zdalnej [[Przekierowanie wyświetlania|via X11]].
+
Razem z pakietem [[Insight II]] przeznaczony do szeroko rozumianego modelowania molekularnego w środowisku 3D. Składa się ze zintegrowanego środowiska użytkownika oraz modułów pozwalających na modelowanie, modyfikowanie, wizualizację i analizę dużych układów biomolekularnych (np. białek, kwasów nukleinowych) oraz chemii i fizyki nowych materiałów, od modelowania homologii do projektowania katalizatorów. Dostępne tylko dla platformy SGI z możliowością pracy zdalnej [[Przekierowanie wyświetlania|via X11]].
 +
 
 +
====Licencja====
 +
Funkcjonalności materiałowe produktu Cerius2 rozwijane są w nowym pakiecie firmy Accelrys [[Materisla Studio]]. W związku z tym część modułów Cerius2 została wycofana ze sprzedaży i nie jest już dłużej dostępna z interfejsu, są to: C2.GULP i C2.Sorption.
  
 
====Uruchamianie aplikacji====
 
====Uruchamianie aplikacji====
<!--
 
Obliczenia testowe należy wstawiać do kolejki shortMSI lub short. Poszczególne programy uruchamia się używając jednej z komend (lokalizacja: /usr/local/bin):
 
-->
 
 
Cerius2 uruchamia się w trybie interaktywnym poleceniem:
 
Cerius2 uruchamia się w trybie interaktywnym poleceniem:
  
Linia 15: Linia 15:
 
uruchomiony zostanie interfejs graficzny - należy przygotować dane i wygenerować skrypt, który następnie należy wstawić do systemu kolejkowania [[PBS]].
 
uruchomiony zostanie interfejs graficzny - należy przygotować dane i wygenerować skrypt, który następnie należy wstawić do systemu kolejkowania [[PBS]].
  
<!--
 
====Wstawianie zadań do kolejki====
 
Wszystkie pakiety Accelrys mają wspólne kolejki [[LSF]] na Tezro: MSI i shortMSI. Zadania należy uruchamiać posługując się poleceniem '''bsub''', bliżej omówionym w artykule [[System
 
kolejkowy|System kolejkowania]].
 
-->
 
 
====Dokumentacja====
 
====Dokumentacja====
 
Dokumentacja w formie książkowej dostępna jest w [[WCSS]], pok. 6.
 
Dokumentacja w formie książkowej dostępna jest w [[WCSS]], pok. 6.

Wersja z 06:46, 2 mar 2010

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Accelrys

Cerius2 - oprogramowanie chemiczne firmy Accelrys.

Razem z pakietem Insight II przeznaczony do szeroko rozumianego modelowania molekularnego w środowisku 3D. Składa się ze zintegrowanego środowiska użytkownika oraz modułów pozwalających na modelowanie, modyfikowanie, wizualizację i analizę dużych układów biomolekularnych (np. białek, kwasów nukleinowych) oraz chemii i fizyki nowych materiałów, od modelowania homologii do projektowania katalizatorów. Dostępne tylko dla platformy SGI z możliowością pracy zdalnej via X11.

Licencja

Funkcjonalności materiałowe produktu Cerius2 rozwijane są w nowym pakiecie firmy Accelrys Materisla Studio. W związku z tym część modułów Cerius2 została wycofana ze sprzedaży i nie jest już dłużej dostępna z interfejsu, są to: C2.GULP i C2.Sorption.

Uruchamianie aplikacji

Cerius2 uruchamia się w trybie interaktywnym poleceniem:

> cerius2         (domyślnie najnowsza wersja pakietu) 

uruchomiony zostanie interfejs graficzny - należy przygotować dane i wygenerować skrypt, który następnie należy wstawić do systemu kolejkowania PBS.

Dokumentacja

Dokumentacja w formie książkowej dostępna jest w WCSS, pok. 6.

Cerius2 w sieci:

Zobacz też : Licencja i żetony