Cerius2: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
Linia 1: Linia 1:
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < [[Accelrys]]</small>
+
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < [[Accelrys]] < Cerius2 </small>
{{aplikacja|nazwa=Cerius<sup>2</sup>|serwer=[[Tezro]]|wersja=4.10 }}
+
{{aplikacja|logo=[[Plik:Accelrys_logo.gif|133px]] |nazwa=Cerius<sup>2</sup>|serwer=[[Tezro]]|wersja=4.10 |kontakt=admin@kdm.wcss.wroc.pl}}
 
'''Cerius<sup>2</sup>''' - spadkowe oprogramowanie chemiczne firmy [[Accelrys]], obecnie funkcjonalności materiałowe produktu Cerius2 rozwijane są w nowym pakiecie tej firmy: [[Materials Studio]]. Razem z pakietem [[Insight II]] przeznaczony był do szeroko rozumianego modelowania molekularnego w środowisku 3D. Składa się ze zintegrowanego środowiska użytkownika oraz modułów pozwalających na modelowanie, modyfikowanie, wizualizację i analizę dużych układów biomolekularnych (np. białek, kwasów nukleinowych) oraz chemii i fizyki nowych materiałów, od modelowania homologii do projektowania katalizatorów. Pakiet dostępny jest tylko dla platformy SGI z możliwością pracy zdalnej [[Przekierowanie wyświetlania|via X11]].
 
'''Cerius<sup>2</sup>''' - spadkowe oprogramowanie chemiczne firmy [[Accelrys]], obecnie funkcjonalności materiałowe produktu Cerius2 rozwijane są w nowym pakiecie tej firmy: [[Materials Studio]]. Razem z pakietem [[Insight II]] przeznaczony był do szeroko rozumianego modelowania molekularnego w środowisku 3D. Składa się ze zintegrowanego środowiska użytkownika oraz modułów pozwalających na modelowanie, modyfikowanie, wizualizację i analizę dużych układów biomolekularnych (np. białek, kwasów nukleinowych) oraz chemii i fizyki nowych materiałów, od modelowania homologii do projektowania katalizatorów. Pakiet dostępny jest tylko dla platformy SGI z możliwością pracy zdalnej [[Przekierowanie wyświetlania|via X11]].
  
====Licencja====
+
== Licencja ==
 
Funkcjonalności materiałowe produktu Cerius2 rozwijane są w nowym pakiecie firmy Accelrys [[Materials Studio]]. W związku z tym, część modułów Cerius2 została wycofana ze sprzedaży i nie jest już dłużej dostępna z interfejsu, są to: C2.GULP i C2.Sorption. Brak licencji na te moduły powoduje, że polecenia w menu, które je uruchamiają, są nieaktywne.
 
Funkcjonalności materiałowe produktu Cerius2 rozwijane są w nowym pakiecie firmy Accelrys [[Materials Studio]]. W związku z tym, część modułów Cerius2 została wycofana ze sprzedaży i nie jest już dłużej dostępna z interfejsu, są to: C2.GULP i C2.Sorption. Brak licencji na te moduły powoduje, że polecenia w menu, które je uruchamiają, są nieaktywne.
  
====Uruchamianie aplikacji====
+
=== Informacje o wykorzystaniu ===
Cerius2 uruchamia się w trybie interaktywnym poleceniem:
+
{{Podziękowanie_WCSS}}
 +
 
 +
== Uruchamianie aplikacji ==
 +
Cerius2 dostępny jest na [[Tezro]] i uruchamia się go w trybie interaktywnym poleceniem:
  
 
  > '''cerius2'''
 
  > '''cerius2'''
  
uruchomiony zostanie interfejs graficzny - należy przygotować dane i wygenerować skrypt, który następnie należy wstawić do systemu kolejkowania [[PBS]].
+
Uruchomiony zostanie interfejs graficzny - należy przygotować dane i wygenerować skrypt, który następnie należy wstawić do systemu kolejkowania [[PBS]].
  
====Dokumentacja====
+
== Dokumentacja ==
 
Dokumentacja w formie książkowej dostępna jest w [[WCSS]], pok. 6.
 
Dokumentacja w formie książkowej dostępna jest w [[WCSS]], pok. 6.
  

Wersja z 12:44, 17 lip 2012

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Accelrys < Cerius2

Cerius2
Accelrys logo.gif
Serwer Wersja
Tezro 4.10
Kontakt
admin@kdm.wcss.wroc.pl

Cerius2 - spadkowe oprogramowanie chemiczne firmy Accelrys, obecnie funkcjonalności materiałowe produktu Cerius2 rozwijane są w nowym pakiecie tej firmy: Materials Studio. Razem z pakietem Insight II przeznaczony był do szeroko rozumianego modelowania molekularnego w środowisku 3D. Składa się ze zintegrowanego środowiska użytkownika oraz modułów pozwalających na modelowanie, modyfikowanie, wizualizację i analizę dużych układów biomolekularnych (np. białek, kwasów nukleinowych) oraz chemii i fizyki nowych materiałów, od modelowania homologii do projektowania katalizatorów. Pakiet dostępny jest tylko dla platformy SGI z możliwością pracy zdalnej via X11.

Licencja

Funkcjonalności materiałowe produktu Cerius2 rozwijane są w nowym pakiecie firmy Accelrys Materials Studio. W związku z tym, część modułów Cerius2 została wycofana ze sprzedaży i nie jest już dłużej dostępna z interfejsu, są to: C2.GULP i C2.Sorption. Brak licencji na te moduły powoduje, że polecenia w menu, które je uruchamiają, są nieaktywne.

Informacje o wykorzystaniu

Wszelkie publikacje, (w tym prace doktorskie i dyplomowe) wykorzystujące wyniki obliczeń wykonanych na komputerach WCSS, powinny zawierać podziękowania postaci (odpowiednio do języka publikacji):

"Obliczenia wykonano na komputerach Wrocławskiego Centrum Sieciowo-Superkomputerowego (http://www.wcss.pl), grant obliczeniowy Nr ... "

"Calculations have been carried out in Wroclaw Centre for Networking and Supercomputing (http://www.wcss.pl), grant No. ..."

Uruchamianie aplikacji

Cerius2 dostępny jest na Tezro i uruchamia się go w trybie interaktywnym poleceniem:

> cerius2

Uruchomiony zostanie interfejs graficzny - należy przygotować dane i wygenerować skrypt, który następnie należy wstawić do systemu kolejkowania PBS.

Dokumentacja

Dokumentacja w formie książkowej dostępna jest w WCSS, pok. 6.

Cerius2 w sieci:

  • Cerius2 - strona niedostępna, produkt został wycofany ze sprzedaży.

Zobacz też : Licencja i żetony