Computational Approaches for Bio-marker Design: A three-levels learning workshop: Różnice pomiędzy wersjami
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
| Linia 1: | Linia 1: | ||
| − | Wrocławskie Centrum Sieciowo-Superkomputerowe oraz Zakład Chemii Teoretycznej Politechniki Wrocławskiej mają przyjemność zaprosić Państwa do udziału w warsztatach | + | Wrocławskie Centrum Sieciowo-Superkomputerowe oraz Zakład Chemii Teoretycznej Politechniki Wrocławskiej mają przyjemność zaprosić Państwa do udziału w warsztatach pt. ''"Computational Approaches for Bio-marker Design: A three-levels learning workshop"''. |
* '''Termin''': 23-27 czerwca 2014 | * '''Termin''': 23-27 czerwca 2014 | ||
| Linia 8: | Linia 8: | ||
== Tematyka warsztatów == | == Tematyka warsztatów == | ||
| − | W trakcie warsztatów zaprezentowane zostaną zarówno podstawowe, jak i zaawansowane narzędzia chemii obliczeniowej pozwalające na badania właściwości strukturalnych i spektroskopowych molekuł | + | Warsztaty poświęcone będą zagadnieniom dotyczącym modelowania liniowych i nieliniowych właściwości optycznych cząsteczek. |
| + | W trakcie warsztatów zaprezentowane zostaną zarówno podstawowe, jak i zaawansowane narzędzia chemii obliczeniowej pozwalające na badania właściwości strukturalnych i spektroskopowych molekuł. Między innymi omówione zostaną metody dynamiki molekularnej (Born-Oppenheimer MD, Car-Parrinello MD), jak również metody hybrydowe (QM/MM oraz TD-DFT/MM). | ||
Szczegóły w załączonym [http://kdm.wcss.wroc.pl/wiki/Plik:course.pdf Programie warsztatów] | Szczegóły w załączonym [http://kdm.wcss.wroc.pl/wiki/Plik:course.pdf Programie warsztatów] | ||
== Informacje techniczne == | == Informacje techniczne == | ||
| − | * ''' | + | * '''Do pełnego uczestnictwa w szkoleniu niezbędne będą własne komputery pozwalające na dostęp do sieci bezprzewodowej (która będzie zapewniona przez WCSS).''' |
| − | * Należy samodzielnie zainstalować program do łączenia / transferu danych (dla | + | * Należy samodzielnie zainstalować program do łączenia / transferu danych (dla Linuksa typowe komendy ssh, sftp; dla Windows - np. putty jako klient SSH, winscp jako klient SFTP) i przetestować łączenie z własnym kontem na klastrze Supernova. |
* W trakcie warsztatów wykorzystywany będzie program VMD. W celu uzyskania dostępu do programu VMD na klastrze supernova należy zarejestrować się na stronie producenta i przesłać zrzutu ekranu po zalogowaniu na stronie dostawcy http://www.ks.uiuc.edu/ na adres franciszek.klajn at pwr.edu.pl . | * W trakcie warsztatów wykorzystywany będzie program VMD. W celu uzyskania dostępu do programu VMD na klastrze supernova należy zarejestrować się na stronie producenta i przesłać zrzutu ekranu po zalogowaniu na stronie dostawcy http://www.ks.uiuc.edu/ na adres franciszek.klajn at pwr.edu.pl . | ||
* Szkolenie prowadzone będzie w języku angielskim. | * Szkolenie prowadzone będzie w języku angielskim. | ||
| + | * W sali są sieci WiFi: EDUROAM, WCSS-GOSCIE i WCSS-GOSCIE-PSK. | ||
* Organizatorzy nie zapewniają posiłków w trakcie przerw obiadowych. | * Organizatorzy nie zapewniają posiłków w trakcie przerw obiadowych. | ||
| − | |||
* Wszelkie pytania w sprawie szkolenia prosimy kierować na adres: justyna.kozlowska at pwr.edu.pl lub dzwonić pod nr telefonu: 71 320 20 43. | * Wszelkie pytania w sprawie szkolenia prosimy kierować na adres: justyna.kozlowska at pwr.edu.pl lub dzwonić pod nr telefonu: 71 320 20 43. | ||
Wersja z 07:53, 10 cze 2014
Wrocławskie Centrum Sieciowo-Superkomputerowe oraz Zakład Chemii Teoretycznej Politechniki Wrocławskiej mają przyjemność zaprosić Państwa do udziału w warsztatach pt. "Computational Approaches for Bio-marker Design: A three-levels learning workshop".
- Termin: 23-27 czerwca 2014
- Miejsce: sala 201, bud. D-21 Politechniki Wrocławskiej, Wrocław (Położenie WCSS)
- Rejestracja uczestników szkolenia: 23 czerwca 2014 godz. 9:00-9:30, bud. D-21 Politechniki Wrocławskiej
- Prowadzący: Doktor Arul Murugan oraz Doktor Xin Li z Królewskiego Instytutu Technologicznego w Sztokholmie
- Warunki uczestnictwa: Wcześniejsza rejestracja (kontakt justyna.kozlowska at pwr.edu.pl)
Tematyka warsztatów
Warsztaty poświęcone będą zagadnieniom dotyczącym modelowania liniowych i nieliniowych właściwości optycznych cząsteczek. W trakcie warsztatów zaprezentowane zostaną zarówno podstawowe, jak i zaawansowane narzędzia chemii obliczeniowej pozwalające na badania właściwości strukturalnych i spektroskopowych molekuł. Między innymi omówione zostaną metody dynamiki molekularnej (Born-Oppenheimer MD, Car-Parrinello MD), jak również metody hybrydowe (QM/MM oraz TD-DFT/MM).
Szczegóły w załączonym Programie warsztatów
Informacje techniczne
- Do pełnego uczestnictwa w szkoleniu niezbędne będą własne komputery pozwalające na dostęp do sieci bezprzewodowej (która będzie zapewniona przez WCSS).
- Należy samodzielnie zainstalować program do łączenia / transferu danych (dla Linuksa typowe komendy ssh, sftp; dla Windows - np. putty jako klient SSH, winscp jako klient SFTP) i przetestować łączenie z własnym kontem na klastrze Supernova.
- W trakcie warsztatów wykorzystywany będzie program VMD. W celu uzyskania dostępu do programu VMD na klastrze supernova należy zarejestrować się na stronie producenta i przesłać zrzutu ekranu po zalogowaniu na stronie dostawcy http://www.ks.uiuc.edu/ na adres franciszek.klajn at pwr.edu.pl .
- Szkolenie prowadzone będzie w języku angielskim.
- W sali są sieci WiFi: EDUROAM, WCSS-GOSCIE i WCSS-GOSCIE-PSK.
- Organizatorzy nie zapewniają posiłków w trakcie przerw obiadowych.
- Wszelkie pytania w sprawie szkolenia prosimy kierować na adres: justyna.kozlowska at pwr.edu.pl lub dzwonić pod nr telefonu: 71 320 20 43.
Harmonogram warsztatów
Każdego dnia warsztatów zajęcia odbywać się będą w następujących godzinach:
| 9:30 - 11:00 | 11:00 - 11:30 | 11:30 - 13:30 | 13:30 - 15:00 | 15:00 - 17:00 | ||||||||||||||||||||
| Wykład | Przerwa kawowa | Zajęcia praktyczne | Przerwa obiadowa | Zajęcia z programowania |
Bloki tematyczne warsztatów
- Poniedziałek (23.06.2014): "The fundamental theories behind the computational methods"
- Wtorek (24.06.2014): "Computational approaches to understand atoms, molecules and materials"
- Środa (25.06.2014): "Nothing is in vacuum: Modeling condensed phase systems"
- Czwartek (26.06.2014): "Let there be light: Modeling the light-matter interaction"
- Piątek (27.06.2014): "Facing the reality: Theory for extended systems interacting with light"