DIRAC: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Skocz do: nawigacji, wyszukiwania
m (Wyniki testów)
m (Wyniki testów)
Linia 47: Linia 47:
 
== Wyniki testów ==
 
== Wyniki testów ==
  
DIRAC 16 został przetestowany narzędziem dostarczonym wraz ze źródłami.Końcowy wynik testów:
+
DIRAC 16 został przetestowany narzędziem dostarczonym wraz ze źródłami. Końcowy wynik testów:
  
 
  100% tests passed, 0 tests failed, out of 105
 
  100% tests passed, 0 tests failed, out of 105

Wersja z 14:16, 5 wrz 2018

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < DIRAC

DIRAC
textDIRAC
Serwer Wersja
Bem 17
16
Kontakt
kdm@wcss.pl


DIRAC - oprogramowanie do obliczeń kwantowo-chemicznych.

Pełna nazwa to „Program for Atomic and Molecular Direct Iterative Relativistic All-electron Calculations”, w skrócie PAM DIRAC.

Oprogramowanie pozwala obliczać różne właściwości molekularne za pomocą teorii Hartree-Focka , MP2 , teorii funkcjonału gęstości , interakcji konfiguracji i sprzężonych teorii struktury elektronowej klastra. PAM DIRAC wykorzystuje równanie Diraca jako punkt wyjścia.

Licencja

Program jest dostępny w formie kodu źródłowego dla społeczności akademickiej. Aby pobrać źródła i otrzymać licencję wymagana była rejestracja na stronie diracprogram.org.

Licencja przyznana dla WCSS:

  • No. of users: more than 20
  • Licence type: Site
  • Program use: Academic

Korzystanie w WCSS

DIRAC dostępny jest na klastrze Bem w katalogu /usr/local/dirac/ w wersjach:

  • 16.0 (wersja równoległa)
  • 17.0 (wersja szeregowa)

Środowisko

Środowisko programu należy uruchomić wykonując polecenie odpowiednio do wersji, której chcemy użyć:

> module load dirac/16.0-gcc4.9.2-parallel (dla wersji domyślnej, równloegłej)
> module load dirac/17.0-gcc4.9.2 (dla wersji najnowszej, szeregowej)

Po ustawieniu środowiska dla danej wersji można korzystać z polecenia do uruchamiania programu głównego:

> pam-dirac

Jak korzystać

Należy wpisać w trybie interaktywnym polecenie:

> pam-dirac --help

Przykładowe polecenie:

> pam-dirac --noarch --inp=file.dirac.inp --mol=file.xyz

gdzie:

--inp=INP_FILE      Dirac input file containing the job directives [*.inp]
--mol=MOL_FILE      file containing the basis set and geometry
--noarch            do not create a tgz archive [default: create it]


Link do tutorialu znajdziesz w sekcji dokumentacja.

Zobacz też: jak korzystać z kolejek PBS.

Wyniki testów

DIRAC 16 został przetestowany narzędziem dostarczonym wraz ze źródłami. Końcowy wynik testów:

100% tests passed, 0 tests failed, out of 105

Wyniki testów są dostępne na klastrze Bem:

> less /usr/local/dirac/16.0/gcc4.9.2-parallel/test-dirac.log

Dokumentacja

Linki zewnętrzne:

Tutorial dla początkujących

Forum użytkowników PAM DIRAC

Więcej informacji



Na górę strony