Hmmer: Różnice pomiędzy wersjami
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
(Utworzył nową stronę „HMMR 3.0 HMMR - aplikacja do skanowanie bibliotek białek w poszukiwaniu homologów, porównywania i nakładania sekwencji aminokwasowych. Zaimplementowano w niej dysk...”) |
|||
| Linia 1: | Linia 1: | ||
| − | HMMR 3.0 | + | ==HMMR 3.0== |
HMMR - aplikacja do skanowanie bibliotek białek w poszukiwaniu homologów, porównywania i nakładania sekwencji aminokwasowych. Zaimplementowano w niej dyskretny model Markownikowa. | HMMR - aplikacja do skanowanie bibliotek białek w poszukiwaniu homologów, porównywania i nakładania sekwencji aminokwasowych. Zaimplementowano w niej dyskretny model Markownikowa. | ||
Wersja z 10:36, 4 sie 2010
HMMR 3.0
HMMR - aplikacja do skanowanie bibliotek białek w poszukiwaniu homologów, porównywania i nakładania sekwencji aminokwasowych. Zaimplementowano w niej dyskretny model Markownikowa.
W porównaniu do BLAST, FASTA oraz innych starszych metod bazujących na archaicznych systemach liczenia punktów za dopasowanie(alligment score), HMMR wydaje się być bardziej dokładny, zdolny do wykrycia sekwencji homologicznych białek u organizmów będących w dość znacznym dystansie filogenetycznym.
Wersja 3.0, w przeciwieństwie do starszych, wolniejszych wersji, cechuje sie wydajnościa porównywalną z metodą BLAST.
Opis wg.strony domowej HMMER