Kompilacja aplikacji równoległych: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
Linia 20: Linia 20:
  
 
Najłatwiej skorzystać z wrapera. Wraper to skrypt, który odwołuje się do właściewego kompilatora i ustawia za użytkownika odpowiednie opcje. Opcje związane są m.in. ze sposobem linkowania [http://pl.wikipedia.org/wiki/Biblioteka_wsp%C3%B3%C5%82dzielona bibliotek_współdzielonych](shared objects).
 
Najłatwiej skorzystać z wrapera. Wraper to skrypt, który odwołuje się do właściewego kompilatora i ustawia za użytkownika odpowiednie opcje. Opcje związane są m.in. ze sposobem linkowania [http://pl.wikipedia.org/wiki/Biblioteka_wsp%C3%B3%C5%82dzielona bibliotek_współdzielonych](shared objects).
 +
Pakie kompilatorów zainstalowanych na klastrze "intel" zawiera nastepujące elementy:
 +
*kompilator C - icc
 +
*kompilator C++ - icpc
 +
*kompilator FORTRAN - ifort

Wersja z 13:37, 30 sie 2011

< Podręcznik użytkownika KDM < Kompilacja aplikacji równoległych

Znakomita większość oprogramowania na klastrze zainstalowana jest tak, aby korzystała z któregoś z protokołów wymiany informacji między procesami (mpi, OpenMP, PVM). Podczas kompilacji rónoległych aplikacji należy odnieść się, odpowiednio konfigurując srodowisko systemowe, do bibliotek wspomnianych wyżej protokołów.

Odpowiednie ustawienie środowiska pracy polega na:

  • załadowaniu modułu dla wybranego kompilatora np.
module load intel/12.0 
intel/12.0 load complete
  • załadowaniu odpowiednich bibiliotek mpi-owych np.
 module load mvapich2/1.5.1p1
 mvapich2/1.5.1p1 load complete
Należy pamiętać, aby biblioteki mpi-owe zostały zbudowane wersją kompilatora, na kŧórą wskazują
zmienne środowiskowe.
  • załadowabnie innych bibliotek wymaganych przez kompilowaną aplikację, na przykład matematycznych:
module load mkl/12.0.1.107
mkl/12.0.1.107 load complete


Proces kompilacji

Najłatwiej skorzystać z wrapera. Wraper to skrypt, który odwołuje się do właściewego kompilatora i ustawia za użytkownika odpowiednie opcje. Opcje związane są m.in. ze sposobem linkowania bibliotek_współdzielonych(shared objects). Pakie kompilatorów zainstalowanych na klastrze "intel" zawiera nastepujące elementy:

  • kompilator C - icc
  • kompilator C++ - icpc
  • kompilator FORTRAN - ifort