Kompilacja aplikacji równoległych: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
Linia 21: Linia 21:
  
 
{| class="wikitable" style="text-align:right"
 
{| class="wikitable" style="text-align:right"
|+ Nazwy kompilatorów w pakiecie [http://software.intel.com/en-us/articles/intel-composer-xe/ Intel Composer XE 2011] i odpowiadających im wraperom z mpvapich2-1.5.1b dostępnych na klastrze [[Nova | Supernova]].  
+
|+ Nazwy kompilatorów w pakiecie [http://software.intel.com/en-us/articles/intel-composer-xe/ Intel Composer XE 2011] i odpowiadających im wraperom z mvapich2-1.5.1b dostępnych na klastrze [[Nova | Supernova]].  
 
! nazwa kompilatora
 
! nazwa kompilatora
 
! symbol kompilatora
 
! symbol kompilatora

Wersja z 14:01, 30 sie 2011

< Podręcznik użytkownika KDM < Kompilacja aplikacji równoległych

Znakomita większość oprogramowania na klastrze zainstalowana jest tak, aby korzystała z któregoś z protokołów wymiany informacji między procesami (mpi, OpenMP, PVM). Podczas kompilacji rónoległych aplikacji należy odnieść się, odpowiednio konfigurując srodowisko systemowe, do bibliotek wspomnianych wyżej protokołów.

Ustawienie środowiska pracy polega na:

  • załadowaniu modułu dla wybranego kompilatora np.
module load intel/12.0 
intel/12.0 load complete
  • załadowaniu odpowiednich bibiliotek mpi-owych np.
 module load mvapich2/1.5.1p1
 mvapich2/1.5.1p1 load complete
Należy pamiętać, aby biblioteki mpi-owe zostały zbudowane wersją kompilatora, na kŧórą wskazują
zmienne środowiskowe.
  • załadowabnie innych bibliotek wymaganych przez kompilowaną aplikację, na przykład matematycznych:
module load mkl/12.0.1.107
mkl/12.0.1.107 load complete

Proces kompilacji

Najłatwiej skorzystać z wrapera. Wraper to skrypt, który odwołuje się do właściewego kompilatora i ustawia za użytkownika odpowiednie opcje. Opcje związane są m.in. ze sposobem linkowania współdzielonych_bibliotek (shared objects) mpi-owych.

Nazwy kompilatorów w pakiecie Intel Composer XE 2011 i odpowiadających im wraperom z mvapich2-1.5.1b dostępnych na klastrze Supernova.
nazwa kompilatora symbol kompilatora nazwa wrapera
kompilator C icc mpicc
kompilator C++ icpc mpicxx
kompilator FORTRAN77 ifort mpif77
kompilator FORTRAN90 ifort mpif90