MOLCAS: Różnice pomiędzy wersjami
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
m |
|||
| Linia 1: | Linia 1: | ||
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < Molcas</small> | <small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < Molcas</small> | ||
| − | {{aplikacja|nazwa=Molcas|logo=[[Plik:Molcas.jpg|120px]]|serwer=[[Supernova]]|wersja=7.6}} | + | {{aplikacja|nazwa=Molcas|logo=[[Plik:Molcas.jpg|120px]]|serwer=[[Supernova]]|wersja=7.6 i 7.8}} |
'''Molcas''' - oprogramowanie kwantowo-chemiczne. | '''Molcas''' - oprogramowanie kwantowo-chemiczne. | ||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
== Korzystanie w WCSS == | == Korzystanie w WCSS == | ||
| − | Na klastrze [[Supernova]] dostępna jest wersja '''7.6''' | + | Na klastrze [[Supernova]] dostępna jest wersja '''7.6''' i '''7.8'''. Wersja starsza zostanie wycofana, gdyż działa niestabilnie. |
;Uruchamianie zadań | ;Uruchamianie zadań | ||
| − | |||
| − | + | * Zadanie wstawiamy skryptem '''sub-molcas''', aby poznać składnię wywołaj skrypt bez argumentów: | |
| − | plik.inp - plik z danymi | + | |
| + | sub-molcas | ||
| + | Sposob uzycia: sub-molcas-7.8 plik.inp liczba_procesorow pamiec_w_MB_per_procesor kolejka | ||
| + | plik.inp - plik z danymi wejsciowymi, wyniki w plik.log | ||
| + | |||
| + | * dla zadań w kolejce '''bigmem''' należy używać skryptu '''sub-molcas-7.8-bigmem''': | ||
| + | |||
| + | sub-molcas-7.8-bigmem | ||
| + | Sposob uzycia: /usr/local/bin/sub-molcas-7.8-bigmem plik.inp liczba_rdzeni pamiec_w_MB_per_cale_zadanie | ||
| + | plik.inp - plik z danymi wejsciowymi, wyniki w plik.log | ||
| + | |||
;Uwagi | ;Uwagi | ||
| − | + | Zmienna MOLCASMEM przydzielana jest w ten sposób, że stanowi ok. 83% zadeklarowanej wartości w systemie PBS. Przykładowo, jeśli wyspecyfikujemy 1800 MB per procesor, to MOLCASMEM przyjmie wartość 1500mb. | |
| − | Zmienna MOLCASMEM przydzielana jest w ten sposób, że stanowi ok. 83% zadeklarowanej wartości w systemie PBS. | ||
== Dokumentacja == | == Dokumentacja == | ||
Wersja z 14:14, 18 wrz 2013
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Molcas
| Molcas | |
|---|---|
| |
| Serwer | Wersja |
| Supernova | 7.6 i 7.8 |
| Kontakt | |
| kdm@wcss.pl | |
Molcas - oprogramowanie kwantowo-chemiczne.
Korzystanie w WCSS
Na klastrze Supernova dostępna jest wersja 7.6 i 7.8. Wersja starsza zostanie wycofana, gdyż działa niestabilnie.
- Uruchamianie zadań
- Zadanie wstawiamy skryptem sub-molcas, aby poznać składnię wywołaj skrypt bez argumentów:
sub-molcas Sposob uzycia: sub-molcas-7.8 plik.inp liczba_procesorow pamiec_w_MB_per_procesor kolejka plik.inp - plik z danymi wejsciowymi, wyniki w plik.log
- dla zadań w kolejce bigmem należy używać skryptu sub-molcas-7.8-bigmem:
sub-molcas-7.8-bigmem Sposob uzycia: /usr/local/bin/sub-molcas-7.8-bigmem plik.inp liczba_rdzeni pamiec_w_MB_per_cale_zadanie plik.inp - plik z danymi wejsciowymi, wyniki w plik.log
- Uwagi
Zmienna MOLCASMEM przydzielana jest w ten sposób, że stanowi ok. 83% zadeklarowanej wartości w systemie PBS. Przykładowo, jeśli wyspecyfikujemy 1800 MB per procesor, to MOLCASMEM przyjmie wartość 1500mb.
Dokumentacja
- Molcas w sieci
Zobacz też: Oprogramowanie KDM
| Oprogramowanie naukowe |
Abaqus ⋅ ABINIT ⋅ ADF ⋅ Amber ⋅ ANSYS [ ANSYS CFD: Fluent, CFX, ICEM; Mechanical ] ⋅ AutoDock ⋅ BAGEL ⋅ Beast ⋅ Biovia [ Materials Studio, Discovery Studio ] ⋅ Cfour ⋅ Comsol ⋅ CP2K ⋅ CPMD ⋅ CRYSTAL ⋅ Dalton ⋅ Dask ⋅ DIRAC ⋅ FDS-SMV ⋅ GAMESS ⋅ Gaussian ⋅ Gromacs ⋅ IDL ⋅ Lumerical [ FDTD, MODE ] ⋅ Mathcad ⋅ Mathematica⋅ Matlab ⋅ Molcas ⋅ Molden ⋅ Molpro ⋅ MOPAC ⋅ NAMD ⋅ NBO ⋅ NWChem ⋅ OpenFOAM ⋅ OpenMolcas ⋅ Orca ⋅ Quantum ESPRESSO ⋅ R ⋅ Rosetta ⋅ SIESTA ⋅ Tinker ⋅ TURBOMOLE ⋅ VASP ⋅ VMD ⋅ WIEN2k |
|---|