Matlab

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Matlab

Matlab
Matlab1.png
Serwer Wersja
Supernova R2013a
R2012a
Klaster kampusowy R2012a
Kontakt
kdm@wcss.pl

MATLAB jest środowiskiem obliczeniowym przeznaczonym dla inżynierów i naukowców, umożliwiającym przeprowadzanie obliczeń matematycznych, analizy numerycznej, wizualizacji otrzymanych wyników (2D, 3D), jak również tworzenie algorytmów i programów. Język MATLAB-a jest intuicyjny i wygodny w użyciu, co sprawia, że opracowanie algorytmów jest prostsze niż w przypadku takich języków programowania jak C czy Fortran.

Informacje ogólne

Główne funkcjonalności MATLAB-a:

  • obliczenia numeryczne do szybkiego generowania wyników
  • grafika do wizualizacji i analizy danych
  • interaktywny język i środowisko programistyczne
  • narzędzia do budowy własnego GUI
  • integracja z zewnętrznymi aplikacjami składającymi się z komponentów C, C++, Fortran, Java, COM, Excel.
  • import danych z plików i urządzeń zewnętrznych (dodatkowo dostęp do baz danych i kolejnych urządzeń)
  • konwersja aplikacji MATLAB-a na C i C++ przy użyciu kompilatora.

Licencja udostępniana przez WCSS

Aktualnie dostępna wersja to R2013a dla systemów Linux (x86, x86_64), Mac (Intel) i Windows (Server 2008, Server 2008R2, XP SP3, Vista, 7). Prosimy o kontakt z administratorami w celu wypożyczenia płyt instalacyjnych (tylko DVD). Wymagania pakietu: http://www.mathworks.com/support/sysreq/

W skład pakietu wchodzi szereg dodatkowych narzędzi rozszerzających jego możliwości, ukierunkowanych na rozwiązywanie zadań z danego obszaru. WCSS udostępnia licencję obejmującą szereg pakietów, są to:

  • Matlab (30) - pakiet główny
  • Bioinformatics Toolbox (1)
  • Communications System Toolbox (5) - rozszerza środowisko Matlab o funkcje, wykresy i graficzny interfejs użytkownika stosowane do badania, projektowania, analizy i symulacji algorytmów warstwy fizycznej systemów komunikacji (np. systemy wireless, wireline). Stosowany głównie do pre- i post-processingu.
  • Curve Fitting Toolbox (1) - poprzez interfejs graficzny i command-line udostępnia funkcje dla różnych aplikacji typu curve-fitting.
  • Data Acquisition Toolbox (1) - zestaw funkcji M-file i dynamicznych bibliotek (DLL) MEX-file napisanych w oparciu o środowisko obliczeniowe MATLABa.
  • Spreadsheet Link EX (2) - pakiet pozwala na integrację Matlaba z programem Microsoft Excel.
  • Filter Design HDL Coder (1)
  • Fixed-Point Toolbox (1)
  • Fuzzy Logic Toolbox (1) - rozszerza środowisko MATLABa o narzędzia do projektowania systemów opartych o logikę rozmytą.
  • Global Optimization Toolbox (1)
  • Image Processing Toolbox (1) - przetwarzanie obrazów
  • Neural Network Toolbox (10) - projektowanie i symulacja sieci neuronowych
  • Optimization Toolbox (10) - rozszerza środowisko Matlaba o narzędzia i algorytmy do optymalizacji.
  • Signal Processing Toolbox (10) - przetwarzanie sygnałów
  • DSP System Toolbox (6)- symulacja procesów cyfrowej obróbki sygnałów
  • Simulink (30) - interaktywne środowisko przeznaczone do modelowania, symulacji i analizy dynamicznych systemów.
    • Simulink Design Optimization (1) - zawiera także Simulink Response Optimization, interfejs graficzny (GUI) do dostrajania i optymalizowania systemów sterowania i fizycznych.
    • Simulink Fixed-Point (1)
  • HDL Coder, dawniej Simulink HDL Coder (1)
  • Matlab Coder (1)
  • Statistics Toolbox (1)
  • Wavelet Toolbox (1)
  • Parallel Computing Toolbox (5)
  • Distributed Computing Engine (32)

Licencje zdezaktualizowane:

  • Communications Blockset (5) - rozszerza pakiet Simulink o bibliotekę elementów konstrukcyjnych służących do budowy i symulacji fizycznej warstwy systemów i komponentów komunikacji.
  • Filter Design Toolbox (1)

Uruchamianie na maszynach KDM WCSS

MATLAB dostępny jest na klastrze Supernova w wersji R2010b i R2011a (katalog instalacji odpowiednio: /usr/local/matlab-R2010b oraz /usr/local/matlab_R2011a).

Praca interaktywna

Przed zdalnym uruchomieniem aplikacji w trybie graficznym należy pamiętać o przekierowaniu wyświetlania. W celu pracy interaktywnej z aplikacją należy uruchomić zadanie interaktywne w kolejce, np.:

> qsub -I -X -q short6h
Środowisko aplikacji

MATLAB pobiera ustawienia środowiska z pliku .matlab7rc.sh. Przed uruchomieniem pobiera plik z pierwszej lokalizacji, kolejno przeszukuje: ./ (kat. bieżący), $HOME (kat. domowy użytkownika), $MATLAB/bin (kat. domyślny). Wzorcowy plik .matlabXrc.sh znajduje się w katalogu instalacji danej wersji MATLAB-a $MATLAB/bin/. Użytkownik może skopiować ten plik do swojego katalogu domowego i zmienić w razie potrzeby ustawione wartości zmiennych: ARCH, LD_LIBRARY_PATH, LM_LICENCE_FILE, MATLAB (wskazuje na katalog instalacji) i kilku innych.

Przed użyciem MATLABa należy załadować odpowiedni moduł.

> module load matlab

wczyta najnowszą wersję (R2011b). Można też wybrać starszą poleceniem:

> module load matlab/R2011a

Aby sprawdzić ustawienia przesyłane do MATLAB-a podczas uruchamiania wystarczy wydać polecenie:

> matlab -n

Aplikacja nie zostanie przy tym uruchomiona.

Uruchamianie aplikacji

Do uruchamiania programu służy polecenie:

> matlab


Wstawianie zadań wsadowych do kolejki

Aby wstawić zadanie MATLAB-a do kolejek PBS na klastrze Supernova należy posłużyć się poleceniem qsub lub skorzystać ze skryptu:

> sub-matlab <plik_wej.inp>

Uruchamianie zdalne przez interfejs Matlaba

Aby zlecić zadanie korzystając z interfejsu Matlaba należy wcześniej wykonać odpowiednią konfigurację:

  • pobrać plik [zip] i rozpakować w lokalizacji przeszukiwanej przez Matlaba (listę tych miejsc można znaleźć klikając przycisk Set Path w polu Environment)
  • pobrać plik [zip] i rozpakować w dowolnej lokalizacji (plik Supernova.settings, który jest w archiwum będzie potrzebny w następnym kroku)
  • w polu Environment kliknąć na przycisk Parallel i wybrać pozycję Manage Cluster Profiles
  • w oknie które się pojawi kliknąć na przycisk Add i wybrać pozycję Import
  • wskazać lokalizację pliku Supernova.settings wypakowanego z archiwum
  • zaznaczyć pozycję Supernova na liście Cluster Profile i kliknąć przycisk Edit
  • w części SubmitFunctions należy zmienić 3 parametr funkcji (/home/tyciu), tak aby wskazywał lokalizację własnego katalogu domowego
  • po kliknięciu na przycisk Done można już korzystać ze zdalnego zlecania zadań

Uruchamianie na własnych komputerach

KDM WCSS umożliwia uruchamianie Matlaba na własnych komputerach. Wymaga to zainstalowania Matlaba w trybie network installation z wykorzystaniem serwera licencji zainstalowanego w KDM WCSS. Dostęp do serwera licencji możliwy jest z adresów klasy B 156.17.0.0/16. Inne adresy/klasy dodawane są po indywidualnych konsultacjach z administratorami KDM WCSS.

W celu uzyskania płyt instalacyjnych należy zgłosić się do kierownika działu KDM.

Instalacja na systemach z rodziny Windows

Przed instalacją należy zgłosić się do WCSS po pobranie kodu PLP wymaganego do instalacji. Następnie należy utworzyć i zapisać na dysku plik licencji o dowolnej nazwie i zawierający wiersze:

SERVER menkar.wcss.pl 0007e905907d 27002
USE_SERVER

Następnie należy uruchomić instalację i podać kod PLP oraz ścieżkę do pliku licencji na kolejnych etapach instalacji.

Instalacja na systemach z rodziny Linux/UNIX

Przed instalacją należy zgłosić się do WCSS po pobranie kodu PLP wymaganego do instalacji. Przed uruchomieniem aplikacji należy ustawić zmienną środowiskową LM_LICENSE_FILE na wartość "27002@menkar.wcss.pl":

Shell typu csh (csh, tcsh):

> setenv LM_LICENSE_FILE "27002@menkar.wcss.pl" 

Shell typu sh (sh, bsh, bash, ksh, ...):

> export LM_LICENSE_FILE="27002@menkar.wcss.pl"

Rodzaj shella sprawdzamy przez:

> echo $SHELL

Ewentualny test licencji:

> scieżka/do/katalogu/instalacji/matlab/etc/lmstat -a -c 27002@menkar.wcss.pl

Dokumentacja

  • Dokumentacja on-line dostępna jest lokalnie po zalogowaniu się na klastrze i Nova i wydaniu polecenia doc z poziomu MATLAB-a.
  • "Komputerowa symulacja układów automatycznej regulacji w środowisku MATLAB/SIMULINK" s.132 rw.2005, Łysakowska B., Mzyk G., ISBN: 83-7085-854-6, Oficyna Wydawnicza PWr (Cena: 17,90)
    W książce rozważa się zagadnienie symulacji komputerowej liniowych systemów dynamicznych z czasem ciągłym i czasem dyskretnym. Analizuje się właściwości Układów Automatycznej Regulacji, podając jednocześnie przykłady praktycznych zastosowań. Badania prowadzone są z użyciem pakietu Control System Toolbox programu Matlab w środowisku graficznym Simulink. Prezentowane są również podstawy identyfikacji liniowych systemów dynamicznych w warunkach losowych. Podręcznik jest przeznaczony dla studentów uczelni technicznych na kierunkach automatyka i robotyka, elektronika i telekomunikacja oraz informatyka, a także dla wszystkich zainteresowanych zastosowaniami środowiska Matlab w obliczeniach inżynierskich w automatyce.
  • "Programowanie w Matlabie dla elektryków" s.215,rw. 2005, Sobierajski M., Łabuzek M., Oficyna Wydawnicza PWr (Cena: 22,00)
    Celem autorów jest nauczenie elektryków posługiwania się Matlabem do rozwiązywania praktycznych zadań inżynierskich. Główną uwagę skoncentrowano na skondensowanym wykorzystaniu Matlaba do rozwiązywania praktycznych zadań elektrotechnicznych i elektroenergetycznych.
    Spis treści
    Wstęp
    1. Pierwsze kroki w Matlabie
    2. Podstawowe operacje macierzowe i tablicowe
    3. Tworzenie skryptów i współpraca z plikami danych
    4. Tworzenie plików funkcyjnych
    5. Wykresy w Matlabie
    6. Interfejs graficzny użytkownika
    7. Rozwiązywanie zadań opisanych równaniami różniczkowymi
    8. Współpraca z plikami zewnętrznymi
    9. Rozwiązywanie zadań optymalizacji
    10. Analiza statystyczna pomiarów
    11. Analiza harmonicznych
    12. Równania różniczkowe
    13. Analiza stabilności lokalnej i globalnej
    14. Rozwiązywanie równań różniczkowych z elementami nieliniowymi
    15. Wprowadzenie do Simulinka
    16. Modelowanie równania różniczkowego
    17. Modelowanie układu równań różniczkowych
    18. Grupowanie i maskowanie bloków
    Literatura
MATLAB w sieci

Zobacz też: Oprogramowanie KDM