Molden: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
Linia 9: Linia 9:
 
* Zaawansowany edytor Z-Matrix.
 
* Zaawansowany edytor Z-Matrix.
  
;Aby uruchomić Moldena na Supernovej należy:
+
;Uruchomienie programu Molden:
# zalogować się z [[Przekierowanie wyświetlania|przekierowaniem wyświetlania]]
+
 
# wstawić graficzne zadanie interaktywne
+
* Do uruchomiania programów graficzanych, zalecane jest łączenie się ze zdalnym pulpitem za pomocą programu NoMachine [http://kdm.wcss.wroc.pl/wiki/Jak_korzysta%C4%87_z_NoMachine Instrukcja]
#:<pre>$ qsub -I -X -l software=Molden</pre>
+
*Aby uruchomić program, należy w terminalu użyć komendy:
# załadować moduł molden
+
> molden
#:<pre>$ module load molden</pre>
 
# uruchomić program poleceniem molden
 
#:<pre>$ molden</pre>
 
  
 
;Informacje o wykorzystaniu  
 
;Informacje o wykorzystaniu  

Wersja z 07:28, 22 lip 2014

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Molden

Molden
Molden.gif
Serwer Wersja
Supernova 5.0
Kontakt
kdm@wcss.pl

Molden - program do pre- i postprocessingu struktur molekularnych.

Główne zastosowania
  • Czytanie outputu z programów chemicznych takich jak Gaussian, Gamess i Molpro.
  • Tworzenie graficznego formatu orbitali molekularnych i gęstości molekularnej.
  • Animacja ścieżki reakcji.
  • Zaawansowany edytor Z-Matrix.
Uruchomienie programu Molden
  • Do uruchomiania programów graficzanych, zalecane jest łączenie się ze zdalnym pulpitem za pomocą programu NoMachine Instrukcja
  • Aby uruchomić program, należy w terminalu użyć komendy:
> molden
Informacje o wykorzystaniu

Wszelkie publikacje, (w tym prace doktorskie i dyplomowe) wykorzystujące wyniki obliczeń wykonanych na komputerach WCSS, powinny zawierać podziękowania postaci (odpowiednio do języka publikacji):

"Obliczenia wykonano na komputerach Wrocławskiego Centrum Sieciowo-Superkomputerowego (http://www.wcss.pl), grant obliczeniowy Nr ... "

"Calculations have been carried out in Wroclaw Centre for Networking and Supercomputing (http://www.wcss.pl), grant No. ..."

Molden w sieci

Zobacz też : oprogramowanie KDM