Orca: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
Linia 7: Linia 7:
  
 
W przypadku użycia programu autorzy wymagają cytowania w publikacjach następującej pracy (p. 4 licencji):<br/> '''''"Neese, F. ORCA – an ab initio, Density Functional and Semiempirical program package, Version 2.5. University of Bonn, 2006."'''''
 
W przypadku użycia programu autorzy wymagają cytowania w publikacjach następującej pracy (p. 4 licencji):<br/> '''''"Neese, F. ORCA – an ab initio, Density Functional and Semiempirical program package, Version 2.5. University of Bonn, 2006."'''''
 +
 +
Manual podaje, które artykuły należy cytować w związku z wykorzystaniem konkretnych metod.
  
 
=== Korzystanie ===
 
=== Korzystanie ===

Wersja z 09:51, 10 kwi 2012

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe

Orca
Serwer Wersja
Supernova 2.8.0.2
Kontakt
kdm@wcss.pl

Orca - oprogramowanie chemiczne do obliczeń metodą ab initio, DFT i półempiryczne SCF-MO.

Licencja

WCSS udostępnia program do wykorzystania w celach naukowych, nie komercyjnych.

W przypadku użycia programu autorzy wymagają cytowania w publikacjach następującej pracy (p. 4 licencji):
"Neese, F. ORCA – an ab initio, Density Functional and Semiempirical program package, Version 2.5. University of Bonn, 2006."

Manual podaje, które artykuły należy cytować w związku z wykorzystaniem konkretnych metod.

Korzystanie

Środowisko aplikacji

Do prostego ustawiania środowiska programu można skorzystać z mechanizmu modułów:

module load orca

Powyższe polecenie ustawia odpowiednie ścieżki dostępu do aktualnie najnowszej wersji programu, w tym do polecenia orca i pozostałych poleceń wywołujących poszczególne moduły.

Uruchamianie zadań

Zadanie do kolejki wstawia się poleceniem:

sub-orca-seq plik_wejsciowy [kolejka] [pamiec_w_MB]

Gdzie:

  • Parametry w nawiasach [ ] są opcjonalne
  • Domyślne wartości:
    • kolejka = normal
    • pamiec_w_MB = 1800

Dokumentacja