Quantum ESPRESSO: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Skocz do: nawigacji, wyszukiwania
(Utworzono nową stronę "<small>< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < BAGEL</small> {{aplikacja|nazwa=Quantum ESPRESSO|logo=Plik:logo_qe.jp...")
 
 
(Nie pokazano 2 wersji utworzonych przez 2 użytkowników)
Linia 1: Linia 1:
 
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < BAGEL</small>
 
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < BAGEL</small>
{{aplikacja|nazwa=Quantum ESPRESSO|logo=[[Plik:logo_qe.jpg|100px|noframe|center]]|serwer=[[Bem]]|wersja=5.4.0|wersja2=6.2.1|wersja3='''6.3'''}}
+
{{aplikacja|nazwa=Quantum ESPRESSO|logo=[[Plik:logo_qe.jpg|200px|noframe|center]]|serwer=[[Bem]]|wersja=5.4.0|wersja2=6.2.1|wersja3='''6.3'''|wersja4=6.4.1|}}
'''Quantum ESPRESSO''' (''QE'') - zintegrowany pakiet Open Source do obliczeń struktury elektronowej i modelowania materiałów w nanoskali. Opiera się na teorii funkcjonału gęstości, falach płaskich i pseudopotencjach.
+
'''QE''' (''Quantum ESPRESSO'') - zintegrowany pakiet Open Source do obliczeń struktury elektronowej i modelowania materiałów w nanoskali. Opiera się na teorii funkcjonału gęstości, falach płaskich i pseudopotencjach.
  
 
Na klastrze [[Bem]] dostępne są różne wersje QE.
 
Na klastrze [[Bem]] dostępne są różne wersje QE.
  
Załadowanie modułu w powłoce:
+
Po uruchomieniu [[Jak_korzystać_z_kolejek_PBS#Uruchomienie_zadania_interaktywnego|zadania interaktywnego]], np.:
 +
 
 +
qsub -I -l walltime=6:00:00 -l select=1:ncpus=1:mem=2048MB -l software=Quantum_ESPRESSO_6.4.1
 +
 
 +
należy załadować jeden z wybranych modułów w powłoce:
 
  > module load espresso/5.4.0-intel16.0
 
  > module load espresso/5.4.0-intel16.0
 
  > module load espresso/5.4.0-yambo-intel16.0
 
  > module load espresso/5.4.0-yambo-intel16.0
 
  > module load espresso/6.2.1
 
  > module load espresso/6.2.1
 
  > module load espresso/6.3
 
  > module load espresso/6.3
 +
> module load QuantumESPRESSO/6.4.1-intel-2019a
 +
 +
Po załadowaniu modułu należy wywołać jeden wielu z programów wykonywalnych (poniższe są dostępne w wersji 6.4.1):
 +
 +
PWscf (pw.x)
 +
PHonon (ph.x, dynmat.x)
 +
PWneb (neb.x)
 +
PWCOND (pwcond.x)
 +
CP (cp.x)
 +
TurboTDDFT (turbo_lanczos.x, turbo_spectrum.x, turbo_davidson.x, turbo_eels.x)
 +
XSpectra (xspectra.x)
 +
atomic (ld1.x)
 +
hp.x
 +
 +
Postprocessings :
 +
 +
pp.x
 +
dos.x
 +
bands.x
 +
projwfc.x
 +
molecularpdos.x
 +
cppp.x
 +
pw_export.x
 +
ppacf.x
 +
 +
bezpośrednio po nazwie programu:
 +
 +
pw.x < file.in
 +
 +
 +
lub w sposób zrównoleglony np.:
 +
 +
mpirun -np x pw.x -i file.in
 +
 +
gdzie:
 +
 +
x - liczba zrównoleglanych procesów
 +
 +
file.in - plik inputowy
  
  
Linia 18: Linia 61:
 
*[https://www.quantum-espresso.org/ Strona domowa pakietu QE]
 
*[https://www.quantum-espresso.org/ Strona domowa pakietu QE]
 
*[https://www.quantum-espresso.org/resources/users-manual Dokumentacja on-line]
 
*[https://www.quantum-espresso.org/resources/users-manual Dokumentacja on-line]
 
+
*[https://gitlab.com/QEF/q-e Kod programu QE]
  
 
'''Zobacz też:''' [[Oprogramowanie KDM]]
 
'''Zobacz też:''' [[Oprogramowanie KDM]]

Aktualna wersja na dzień 11:07, 14 sty 2020

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < BAGEL

Quantum ESPRESSO
noframe
Serwer Wersja
Bem 5.4.0
6.2.1
6.3
6.4.1
Kontakt
kdm@wcss.pl

QE (Quantum ESPRESSO) - zintegrowany pakiet Open Source do obliczeń struktury elektronowej i modelowania materiałów w nanoskali. Opiera się na teorii funkcjonału gęstości, falach płaskich i pseudopotencjach.

Na klastrze Bem dostępne są różne wersje QE.

Po uruchomieniu zadania interaktywnego, np.:

qsub -I -l walltime=6:00:00 -l select=1:ncpus=1:mem=2048MB -l software=Quantum_ESPRESSO_6.4.1

należy załadować jeden z wybranych modułów w powłoce:

> module load espresso/5.4.0-intel16.0
> module load espresso/5.4.0-yambo-intel16.0
> module load espresso/6.2.1
> module load espresso/6.3
> module load QuantumESPRESSO/6.4.1-intel-2019a

Po załadowaniu modułu należy wywołać jeden wielu z programów wykonywalnych (poniższe są dostępne w wersji 6.4.1):

PWscf (pw.x)
PHonon (ph.x, dynmat.x)
PWneb (neb.x)
PWCOND (pwcond.x)
CP (cp.x)
TurboTDDFT (turbo_lanczos.x, turbo_spectrum.x, turbo_davidson.x, turbo_eels.x)
XSpectra (xspectra.x)
atomic (ld1.x)
hp.x

Postprocessings :

pp.x
dos.x
bands.x
projwfc.x
molecularpdos.x
cppp.x
pw_export.x
ppacf.x

bezpośrednio po nazwie programu:

pw.x < file.in


lub w sposób zrównoleglony np.:

mpirun -np x pw.x -i file.in

gdzie:

x - liczba zrównoleglanych procesów

file.in - plik inputowy


Informacje o wykorzystaniu

Wszelkie publikacje, (w tym prace doktorskie i dyplomowe) wykorzystujące wyniki obliczeń wykonanych na komputerach WCSS, powinny zawierać podziękowania postaci (odpowiednio do języka publikacji):

"Obliczenia wykonano na komputerach Wrocławskiego Centrum Sieciowo-Superkomputerowego (http://www.wcss.pl), grant obliczeniowy Nr ... "

"Calculations have been carried out in Wroclaw Centre for Networking and Supercomputing (http://www.wcss.pl), grant No. ..."

QE w sieci

Zobacz też: Oprogramowanie KDM