Rosetta: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Skocz do: nawigacji, wyszukiwania
m
 
Linia 1: Linia 1:
 
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < Rosetta</small>
 
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < Rosetta</small>
{{aplikacja|nazwa=Rosetta|logo=[[Plik:rosetta.png|noframe|center]]|serwer=[[Supernova]]|wersja=3.2.1}}
+
{{aplikacja|nazwa=Rosetta|logo=[[Plik:rosetta.png|noframe|center]]|serwer=[[Bem]]|wersja=3.10}}
 
=== Rosetta ===
 
=== Rosetta ===
  
Linia 15: Linia 15:
  
 
Środowisko programu inicjalizowane jest w powłoce przez polecenie:
 
Środowisko programu inicjalizowane jest w powłoce przez polecenie:
  > module load rosetta/3.2.1 (dla wersji domyślnej - najnowszej)
+
  > module load Rosetta/3.10-foss-2016b (dla wersji domyślnej - najnowszej)
  
 
=== Rosetta w sieci ===
 
=== Rosetta w sieci ===

Aktualna wersja na dzień 11:50, 31 sty 2020

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Rosetta

Rosetta
noframe
Serwer Wersja
Bem 3.10
Kontakt
kdm@wcss.pl

Rosetta

Program Rosetta służy do modelowania struktury białek. Zaawansowany algorytm umożliwia tworzenie białek, enzymów de novo, łączenie ligandów oraz przewidywanie struktury złożonych kompleksów.

Licencja

Program Rosetta jest dostępny dla komercyjnych i niekomercyjnych użytkowników za darmo. Licencje można uzyskać na stronie Licencja

Środowisko i praca interaktywna

Praca z pakietem w trybie interaktywnym jest możliwa po uruchomieniu zadania interaktywnego w jednej z kolejek PBS, np:

> qsub -I -q short6h

Środowisko programu inicjalizowane jest w powłoce przez polecenie:

> module load Rosetta/3.10-foss-2016b (dla wersji domyślnej - najnowszej)

Rosetta w sieci