Rosetta
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
The printable version is no longer supported and may have rendering errors. Please update your browser bookmarks and please use the default browser print function instead.
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Rosetta
| Rosetta | |
|---|---|
 | |
| Serwer | Wersja |
| Bem | 3.10 |
| Kontakt | |
| kdm@wcss.pl | |
Rosetta
Program Rosetta służy do modelowania struktury białek. Zaawansowany algorytm umożliwia tworzenie białek, enzymów de novo, łączenie ligandów oraz przewidywanie struktury złożonych kompleksów.
Licencja
Program Rosetta jest dostępny dla komercyjnych i niekomercyjnych użytkowników za darmo. Licencje można uzyskać na stronie Licencja
Środowisko i praca interaktywna
Praca z pakietem w trybie interaktywnym jest możliwa po uruchomieniu zadania interaktywnego w jednej z kolejek PBS, np:
> qsub -I -q short6h
Środowisko programu inicjalizowane jest w powłoce przez polecenie:
> module load Rosetta/3.10-foss-2016b (dla wersji domyślnej - najnowszej)
Rosetta w sieci
| Oprogramowanie naukowe |
Abaqus ⋅ ABINIT ⋅ ADF ⋅ Amber ⋅ ANSYS [ ANSYS CFD: Fluent, CFX, ICEM; Mechanical ] ⋅ AutoDock ⋅ BAGEL ⋅ Beast ⋅ Biovia [ Materials Studio, Discovery Studio ] ⋅ Cfour ⋅ Comsol ⋅ CP2K ⋅ CPMD ⋅ CRYSTAL ⋅ Dalton ⋅ Dask ⋅ DIRAC ⋅ FDS-SMV ⋅ GAMESS ⋅ Gaussian ⋅ Gromacs ⋅ IDL ⋅ Lumerical [ FDTD, MODE ] ⋅ Mathcad ⋅ Mathematica⋅ Matlab ⋅ Molcas ⋅ Molden ⋅ Molpro ⋅ MOPAC ⋅ NAMD ⋅ NBO ⋅ NWChem ⋅ OpenFOAM ⋅ OpenMolcas ⋅ Orca ⋅ Quantum ESPRESSO ⋅ R ⋅ Rosetta ⋅ SIESTA ⋅ Tinker ⋅ TURBOMOLE ⋅ VASP ⋅ VMD ⋅ WIEN2k |
|---|