TURBOMOLE
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
The printable version is no longer supported and may have rendering errors. Please update your browser bookmarks and please use the default browser print function instead.
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe
| Turbomole | |
|---|---|
| Serwer | Wersja |
| Supernova | 6.3 6.2 5.10 |
| Kontakt | |
| kdm@wcss.pl | |
TURBOMOLE - pakiet do obliczeń chemicznych metodami ab initio, implementuje wiele algorytmów z zakresu chemii kwantowej.
Korzystanie z Turbomole w WCSS
Pakiet TURBOMOLE zainstalowany jest na klastrze Nova.
- Sposób użycia
Należy wejść do katalogu z plikami wejściowymi, wydać polecenie:
sub-turbomole nazwa_programu [kolejka] [liczba rdzeni]
Gdzie:
<nazwa_programu>to coś z:
aoforce eigerf moloch ricc2_mpi sdg atbandbta escf mpgrad riccprep statpt bsseenergy freeh mpgrad_mpi ridft tm2molden cosmoprep frog mpshift ridft_mpi uff define grad rdgrad rimp2 vibration dscf grad_mpi rdgrad_mpi rimp2prep jobex dscf_mpi intense relax ruecker egrad mdprep ricc2 sammler
- kolejka - to np. parallel
- liczba rdzeni - to liczba rdzeni obliczeniowych przydzielonych zadaniu
Po wykonaniu programu w katalogu pojawi się plik z wynikiem działania o nazwie TURBO_<nazwa_programu>.o*
|
Pliki tymczasowe. TURBOMOLE tworzy niektóre pliki tymczasowe np. twoint1 w katalogu domowym. Zapis do katalogu domowego jest kilkukrotnie wolniejszy niż do scratch. Dlatego ważne jest, aby zmienić odpowiednie ścieżki w pliku control. np. twoint1 na /scratch/nazwa_uzytkownika/twoint1. |
Dokumentacja
Zobacz też: Oprogramowanie KDM
| Oprogramowanie naukowe |
Abaqus ⋅ ABINIT ⋅ ADF ⋅ Amber ⋅ ANSYS [ ANSYS CFD: Fluent, CFX, ICEM; Mechanical ] ⋅ AutoDock ⋅ BAGEL ⋅ Beast ⋅ Biovia [ Materials Studio, Discovery Studio ] ⋅ Cfour ⋅ Comsol ⋅ CP2K ⋅ CPMD ⋅ CRYSTAL ⋅ Dalton ⋅ Dask ⋅ DIRAC ⋅ FDS-SMV ⋅ GAMESS ⋅ Gaussian ⋅ Gromacs ⋅ IDL ⋅ Lumerical [ FDTD, MODE ] ⋅ Mathcad ⋅ Mathematica⋅ Matlab ⋅ Molcas ⋅ Molden ⋅ Molpro ⋅ MOPAC ⋅ NAMD ⋅ NBO ⋅ NWChem ⋅ OpenFOAM ⋅ OpenMolcas ⋅ Orca ⋅ Quantum ESPRESSO ⋅ R ⋅ Rosetta ⋅ SIESTA ⋅ Tinker ⋅ TURBOMOLE ⋅ VASP ⋅ VMD ⋅ WIEN2k |
|---|