VMD: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
 
(Nie pokazano 10 wersji utworzonych przez 3 użytkowników)
Linia 1: Linia 1:
 
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < VMD </small>
 
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < VMD </small>
 +
{{aplikacja|nazwa=VMD|logo=[[Plik:vmd.gif|noframe|center]]|serwer=[[Bem]]|wersja=1.9.3|}}
 +
''VMD'' (Visual Molecular Dynamics) – oprogramowanie do modelowania, wizualizacji i analizy systemów biologicznych (m.in. białek, kwasów nukleinowych, lipidów).
  
'''VMD''' (Visual Molecular Dynamics) – oprogramowanie do modelowania, wizualizacji i analizy systemów biologicznych (m.in. białek, kwasów nukleinowych, lipidów).
+
== Licencja ==
 +
 
 +
Aby uzyskać dostęp do modułu VMD należy dokonać rejestracji na [http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/ stronie domowej produktu], zrobić zrzut ekranu potwierdzający proces rejestracji ([http://kdm.wcss.wroc.pl/wiki/Plik:800px-Screenvmd.png Przykładowy zrzut]), a następnie wysłać na adres kdm@wcss.pl.
 +
 
 +
== Uruchamianie VMD ==
 +
 
 +
* Do uruchomiania programów graficzanych, zalecane jest łączenie się ze zdalnym pulpitem za pomocą programu [http://kdm.wcss.wroc.pl/wiki/Jak_korzysta%C4%87_z_NoMachine NoMachine]. Aby uruchomić program, należy w terminalu uruchomionym w aplikacji NoMachine użyć komendy:
 +
> vmd
 +
* Z programu VMD można także korzystać po uruchomieniu [http://kdm.wcss.wroc.pl/wiki/Jak_korzysta%C4%87_z_kolejek_PBS#Uruchomienie_zadania_interaktywnego zadania interaktywnego] i załadowaniu odpowiedniego [http://kdm.wcss.wroc.pl/wiki/Modu%C5%82y modułu]:
 +
> qsub -X -I -l walltime=6:00:00
 +
> module load vmd/1.9.3-gcc6.2.0
 +
> vmd
 +
 
 +
== VMD w sieci ==
 +
* [http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/ Strona domowa VMD]
 +
* [http://www.ks.uiuc.edu/Training/Tutorials/vmd-index.html Tutoriale]
  
 
'''Zobacz też:''' [[Oprogramowanie KDM]]
 
'''Zobacz też:''' [[Oprogramowanie KDM]]

Aktualna wersja na dzień 09:05, 5 sty 2017

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < VMD

VMD
noframe
Serwer Wersja
Bem 1.9.3
Kontakt
kdm@wcss.pl

VMD (Visual Molecular Dynamics) – oprogramowanie do modelowania, wizualizacji i analizy systemów biologicznych (m.in. białek, kwasów nukleinowych, lipidów).

Licencja

Aby uzyskać dostęp do modułu VMD należy dokonać rejestracji na stronie domowej produktu, zrobić zrzut ekranu potwierdzający proces rejestracji (Przykładowy zrzut), a następnie wysłać na adres kdm@wcss.pl.

Uruchamianie VMD

  • Do uruchomiania programów graficzanych, zalecane jest łączenie się ze zdalnym pulpitem za pomocą programu NoMachine. Aby uruchomić program, należy w terminalu uruchomionym w aplikacji NoMachine użyć komendy:
> vmd
> qsub -X -I -l walltime=6:00:00
> module load vmd/1.9.3-gcc6.2.0
> vmd

VMD w sieci

Zobacz też: Oprogramowanie KDM