Virtualenv: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
 
(Nie pokazano 9 wersji utworzonych przez 3 użytkowników)
Linia 1: Linia 1:
 +
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < Virtualenv</small>
 +
 
'''Virtualenv''' jest narzędziem umożliwiającym tworzenie i zarządzanie środowiskami Pythona. Można je stosować do instalacji pakietów Pythona we własnym katalogu domowym.
 
'''Virtualenv''' jest narzędziem umożliwiającym tworzenie i zarządzanie środowiskami Pythona. Można je stosować do instalacji pakietów Pythona we własnym katalogu domowym.
  
 
== Jak utworzyć i uruchomić środowisko wirtualne ==
 
== Jak utworzyć i uruchomić środowisko wirtualne ==
  
Uruchom zadanie interaktywne i załaduj moduł Pythona
+
Uruchom zadanie interaktywne i załaduj moduł Pythona w wymaganej wersji:
  
 
   qsub -I -l walltime=06:00:00 -l software=python -l select=1:ncpus=1:mem=1000mb
 
   qsub -I -l walltime=06:00:00 -l software=python -l select=1:ncpus=1:mem=1000mb
   module load python
+
   module load Python/MOJA-WYMAGANA-WERSJA
  
Utwórz środowisko wirtualne w wybranym katalogu (w tym przykładzie będzie to katalog $HOME/projekt)
+
Utwórz środowisko wirtualne w wybranym katalogu (w tym przykładzie będzie to katalog $HOME/projekt):
  
 
   virtualenv $HOME/projekt
 
   virtualenv $HOME/projekt
  
Uruchom utworzone środowisko wirtualne
+
Uruchom utworzone środowisko wirtualne:
  
 
   source $HOME/projekt/bin/activate
 
   source $HOME/projekt/bin/activate
Linia 56: Linia 58:
 
W katalogu $HOME/cif2cell/bin utworzony zostanie plik wykonywalny cif2cell.
 
W katalogu $HOME/cif2cell/bin utworzony zostanie plik wykonywalny cif2cell.
  
Aby użyć zainstalowanego oprogramowania cif2cell należy wykonać polecenie
+
Aby użyć zainstalowane oprogramowanie cif2cell należy wykonać polecenie
 
   
 
   
 
   $HOME/cif2cell/bin/cif2cell
 
   $HOME/cif2cell/bin/cif2cell
 +
 +
== Jak użyć oprogramowanie zainstalowane w środowisku wirtualnym - zadanie wsadowe ==
 +
 +
Oprogramowanie, które zostało zainstalowane w środowisku wirtualnym można uruchomić w zadaniu wsadowym.
 +
 +
W tym celu należy umieścić w skrypcie następujące polecenie
 +
 +
  $HOME/cif2cell/bin/cif2cell
 +
 +
 
 +
 +
== Virtualenv w sieci ==
 +
* [https://virtualenv.pypa.io/en/stable/ Dokumentacja]
 +
 +
 +
 +
'''Zobacz też:''' [[Oprogramowanie KDM]], [[Python]]
 +
{{oprogramowanie}}
 +
 +
[[Kategoria:Oprogramowanie]]
 +
[[Kategoria:Podręcznik użytkownika]]

Aktualna wersja na dzień 14:05, 17 mar 2020

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Virtualenv

Virtualenv jest narzędziem umożliwiającym tworzenie i zarządzanie środowiskami Pythona. Można je stosować do instalacji pakietów Pythona we własnym katalogu domowym.

Jak utworzyć i uruchomić środowisko wirtualne

Uruchom zadanie interaktywne i załaduj moduł Pythona w wymaganej wersji:

 qsub -I -l walltime=06:00:00 -l software=python -l select=1:ncpus=1:mem=1000mb
 module load Python/MOJA-WYMAGANA-WERSJA

Utwórz środowisko wirtualne w wybranym katalogu (w tym przykładzie będzie to katalog $HOME/projekt):

 virtualenv $HOME/projekt

Uruchom utworzone środowisko wirtualne:

 source $HOME/projekt/bin/activate

Jak wyłączyć środowisko wirtualne

Użyj polecenia

 deactivate

Przykład instalacji pakietu w środowisku wirtualnym

Poniżej zaprezentowano procedurę instalacji pakietu cif2cell w środowisku wirtualnym Pythona.

Uruchom zadanie interaktywne i załaduj moduł Pythona

 qsub -I -l walltime=06:00:00 -l software=python -l select=1:ncpus=1:mem=1000mb
 module load python

Utwórz środowisko wirtualne w wybranym katalogu (w tym przykładzie będzie to katalog $HOME/cif2cell)

 virtualenv $HOME/cif2cell

Uruchom utworzone środowisko wirtualne

 source $HOME/cif2cell/bin/activate

Zainstaluj odpowiedni pakiet (w tym przypadku do instalacji cif2cell wymagany jest pakiet PyCIFRW)

 pip install PyCIFRW

Zainstaluj oprogramowanie cif2cell w katalogu $HOME/cif2cell.

W tym celu rozpakuj pobrane pliki oprogramowania cif2cell i przejdź do katalogu ze źródłami tego pakietu

 tar -xf cif2cell-1.2.10.tar.gz
 cd cif2cell-1.2.10

oraz uruchom polecenie

 python setup.py install --prefix=$HOME/cif2cell

W katalogu $HOME/cif2cell/bin utworzony zostanie plik wykonywalny cif2cell.

Aby użyć zainstalowane oprogramowanie cif2cell należy wykonać polecenie

 $HOME/cif2cell/bin/cif2cell

Jak użyć oprogramowanie zainstalowane w środowisku wirtualnym - zadanie wsadowe

Oprogramowanie, które zostało zainstalowane w środowisku wirtualnym można uruchomić w zadaniu wsadowym.

W tym celu należy umieścić w skrypcie następujące polecenie

 $HOME/cif2cell/bin/cif2cell


Virtualenv w sieci


Zobacz też: Oprogramowanie KDM, Python