Zastosowania dynamiki molekularnej na przykładach dostępnego oprogramowania - przykłady
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
The printable version is no longer supported and may have rendering errors. Please update your browser bookmarks and please use the default browser print function instead.
- Temat: Zastosowania dynamiki molekularnej na przykładach dostępnego oprogramowania
- Termin: 30 listopada 2009
- Wykładowca: dr Bartłomiej Szyja
Zastosowania dynamiki molekularnej na przykładach dostępnego oprogramowania:
- SIESTA - metoda a zarazem implementacja pozwalająca na oblieczenia struktury elektronowej i dynamiki molekularnej ab-initio dla cząsteczeki ciał stałych. Dzięki wykorzystaniu numerycznych orbitali możliwa jest symulacja dla układów zawierających nawet kilka tysięce atomów.
- CPMD - program wykorzystujący metodę Car-Parrinello do dynamiki molekularnej ab-initio.
- GULP - program umożliwiający symulacje dynamiki molekularnej z wieloma potencjałami:
- shell model - dla układów jonowych,
- embedded atom model - dla metali,
- reactive bond-order potential - dla węglowodorów,
- wiele innych pól siłowych dla pozostałych układów.
- GROMACS - uniwersalny program do dynamiki molekularnej, zaprojektowany głównie do celów biochemicznych, ale używany także do symulacji niebiologicznych układów, np. polimerów.
- ReaxFF - program wykorzystujący reaktywne pole siłowe, umożliwiający badania reakcji chemicznych za pomocą dynamiki molekularnej.
Prezentacje można pobrać korzystając z poniższych linków: Wprowadzenie:
Informacje o poszczególnych kodach: