MPIEXEC
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie systemowe i narzędziowe < MPIEXEC
Mpiexec to narzędzie zastępujące mpirun
, które pozwala na lepszą kontrolę zadań MPI w środowisku kolejkowania zadań PBS. Dotyczy to wyłącznie implementacji MPI, które nie posiadają natywnego wsparcia dla komunikacji z PBS, to jest MPICH, MPICH2, MVAPICH, MVAPICH2. Użycie mpiexec
nie jest wymagane dla OpenMPI.
- Zalety
mpiexec
nie wymaga podawania ani liczby procesorów, ani listy hostów, ani podziału procesorów na węzły - te informacje uzyskiwane są bezpośrednio z systemu kolejkowego PBS;- prawidłowa obsługa sygnałów, można używać polecenia
qdel
do zabijania zadań; - jednoczesna obsługa InfiniBand i SHMEM.
- Użycie
- zadanie kolejkowe należy zlecić podając zasób
ncpus
i jednocześnie zasóbmpiprocs
, np. zadanie interaktywne na 2x4 procesory:
qsub -q short6h -N nazwa -l select=2:ncpus=4:mpiprocs=4:mem=1GB -I
- po uruchomieniu zadania wymagane jest załadowanie modułu wybranej implementacji MPI oraz modułu
mpiexec
, np.:
module load mvapich2 module load mpiexec
- następnie należy wykonać kompilację, np.:
mpicc -o program_mpi.x program_mpi.c
- i uruchomić program:
mpiexec program_mpi.x opcje_programu >& wyniki.txt
Strona domowa projektu: http://www.osc.edu/~pw/mpiexec/index.php