Beast: Różnice pomiędzy wersjami

Wersja z 09:36, 28 wrz 2018

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Beast

Beast

Serwer	Wersja
Bem	2.5.1
Kontakt
kdm@wcss.pl

Beast - program do Bayesowskiej analizy filogenetycznej sekwencji molekularnych, jest opracowywany przez zespół naukowców z całego świata.

Licencja

Program jest udostępniany na licencji GNU Lesser General Public License.

Korzystanie w WCSS

Beast dostępny jest na klastrze Bem w katalogu /usr/local/beast/ w wersji 2.5.1.

/usr/local/beast/
`-- 2.5.1/
    `-- with_jre1.8.0_161/
        |-- LICENSE.txt
        |-- README.txt
        |-- VERSION\ HISTORY.txt
        |-- bin/
        |-- examples/
        |-- images/
        |-- jre1.8.0_161/
        |-- lib/
        `-- templates/

Środowisko

Środowisko programu należy uruchomić wykonując polecenie:

> module load beast/2.5.1-with_JRE

lub w skrócie:

> module load beast

Jak korzystać

Lista dostępnych opcji:

> beast -help

Beast2 używa formatu wejściowego XML.

Beast2 jest kompatybilny z bibliotekami beagle-lib, które również są dostępne na klastrze Bem.

Korzystanie z bibliotek beagle-lib:

> module load beagle/3.0.2-gcc6.2.0

Program posiada również graficzny interfejs użytkownika.

Zobacz: jak korzystać z NoMachine.

Tutorial

Tutorial dla użytkownków Beast2

Dokumentacja

Strona domowa projektu

Oprogramowanie
naukowe

Abaqus ⋅ ABINIT ⋅ ADF ⋅ Amber ⋅ ANSYS [ ANSYS CFD: Fluent, CFX, ICEM; Mechanical ] ⋅ AutoDock ⋅ BAGEL ⋅ Beast ⋅ Biovia [ Materials Studio, Discovery Studio ] ⋅ Cfour ⋅ Comsol ⋅ CP2K ⋅ CPMD ⋅ CRYSTAL ⋅ Dalton ⋅ Dask ⋅ DIRAC ⋅ FDS-SMV ⋅ GAMESS ⋅ Gaussian ⋅ Gromacs ⋅ IDL ⋅ Lumerical [ FDTD, MODE ] ⋅ Mathcad ⋅ Mathematica⋅ Matlab ⋅ Molcas ⋅ Molden ⋅ Molpro ⋅ MOPAC ⋅ NAMD ⋅ NBO ⋅ NWChem ⋅ OpenFOAM ⋅ OpenMolcas ⋅ Orca ⋅ Quantum ESPRESSO ⋅ R ⋅ Rosetta ⋅ SIESTA ⋅ Tinker ⋅ TURBOMOLE ⋅ VASP ⋅ VMD ⋅ WIEN2k

Na górę strony