Tekst źródłowy strony Cząsteczka w otoczeniu chemicznym

Wrocławskie Wrocławskie Centrum Sieciowo-Superkomputerowe ma przyjemność zaprosić Państwa do udziału w trzydniowych warsztatach  pt. "''Cząsteczka w otoczeniu chemicznym''"
* '''Termin''': 25-27 lutego 2015  godz. 10:00-16:00
* '''Miejsce''': sala 201, bud. D-21 PWr, Wrocław ([http://wcss.pl/?c=static_contact Położenie WCSS])
* '''Prowadzący''': Prof. Wojciech Bartkowiak, Dr hab. Robert Góra, Dr Paweł Lipkowski, Zakład Chemii Fizycznej i Kwantowej, Politechnika Wrocławska
* '''Warunki uczestnictwa''': wcześniejsza rejestracja (pod adresem justyna.kozlowska at pwr.edu.pl) 
Pytania w sprawie szkolenia prosimy kierować na adres: justyna.kozlowska at pwr.edu.pl lub dzwonić pod nr telefonu: 71 320 20 43. 

== Tematyka ==
W ramach warsztatów zaprezentowane zostaną metody teoretyczne stosowane w
badaniach właściwości fizykochemicznych molekuł w fazach skondensowanych.

Szkolenie dotyczyć będzie następujących zagadnień:
* modele rozpuszczalnika stosowane w obliczeniach kwantowo-chemicznych (ze szczególnym uwzględnieniem ciągłych modeli rozpuszczalnika),
* procedura wyznaczania energii oddziaływania międzymolekularnego kompleksów molekularnych znajdujących się w fazach skondensowanych,
* metody teoretyczne stosowane w opisie właściwości układów ograniczonych przestrzennie (kompleksy endohedralne, materia w warunkach wysokiego ciśnienia),
* kwantowa teoria atomów w cząsteczkach ('''QTAIM''') - podstawy teoretyczne i aplikacyjne na przykładzie kompleksów z wiązaniem wodorowym.

== Informacje techniczne ==
* '''Do pełnego uczestnictwa w warsztatach niezbędne będą własne laptopy pozwalające na dostęp do sieci bezprzewodowej (która będzie zapewniona przez WCSS).'''
* Należy samodzielnie zainstalować program do łączenia / transferu danych (dla Linuksa typowe komendy ssh, sftp; dla Windows - np. putty jako klient SSH, winscp jako klient SFTP) i przetestować łączenie z własnym kontem na klastrze Supernova. 
* Wskazana jest znajomość podstawowych pojęć chemii kwantowej, doświadczenie w prowadzeniu prostych obliczeń kwantowo-chemicznych oraz manipulacji plikami w systemie Linux.
* Część warsztatowa odbywać się będzie z wykorzystaniem zasobów WCSS. Wobec tego wymagane jest posiadanie konta obliczeniowego na klastrze Supernova ([http://kdm.wcss.wroc.pl/wiki/Jak_zosta%C4%87_u%C5%BCytkownikiem_KDM Jak zostać użytkownikiem KDM WCSS]).
*  Organizatorzy nie zapewniają posiłków w trakcie przerw obiadowych. 

== Plan warsztatów ==
{| class="wikitable" style="width:95%"
|- style="background-color:#D8D8D8;"
| colspan="5" align="left" style="font-size: 120%; font-variant: small-caps; font-weight: bold" | Środa, 25 lutego 2015
|-  align="left"
| style="background-color:#F9F9F" width="100px" | '''9:00 - 9:50'''
| style="background-color:#F9F9F" colspan="4" | Rejestracja uczestników szkolenia
|-  align="left"
| style="background-color:#F9F9F" width="100px" | '''10:00 - 11:00'''
| style="background-color:#F9F9F" colspan="4" | Wykład – Modelowanie efektów rozpuszczalnikowych I:
* Koszt energetyczny solwatacji i entalpia swobodna solwatacji
* Klasyczne modele ciągłe rozpuszczalnika
|-  align="left"
| style="background-color:#F9F9F" width="100px" | '''11:00 - 11:15'''
| style="background-color:#F9F9F" colspan="4" | Przerwa kawowa
|-  align="left"
| style="background-color:#F9F9F" width="100px" | '''11:15 - 12:15'''
| style="background-color:#F9F9F" colspan="4" | Wykład – Modelowanie efektów rozpuszczalnikowych II:
* Model PCM oraz jego warianty
|-  align="left"
| style="background-color:#F9F9F" width="100px" | '''12:15 - 13:15'''
| style="background-color:#F9F9F" colspan="4" | Przerwa obiadowa
|-  align="left"
| style="background-color:#F9F9F" width="100px" | '''13:15 - 15:15'''
| style="background-color:#F9F9F" colspan="4" | Część warsztatowa:
* Wyznaczanie entalpii swobodnej solwatacji
* Metoda efektywnych potencjałów fragmentów
* Wyznaczanie widm absorpcji oraz fluorescencji molekuł w rozpuszczalniku
|-  align="left"
| style="background-color:#F9F9F" width="100px" | '''15:15 - 15:30'''
| style="background-color:#F9F9F" colspan="4" | Przerwa kawowa
|-  align="left"
| style="background-color:#F9F9F" width="100px" | '''15:30 - 17:00'''
| style="background-color:#F9F9F" colspan="4" | Czas pracy własnej
|- style="background-color:#D8D8D8;"
| colspan="5" align="left" style="font-size: 120%; font-variant: small-caps; font-weight: bold" | Czwartek, 26 lutego 2015
|-  align="left"
| style="background-color:#F9F9F" width="100px" | '''10:00 - 11:00'''
| style="background-color:#F9F9F" colspan="4" | Wykład – Modelowanie efektów rozpuszczalnikowych III:
* Energia oddziaływania miedzycząsteczkowego w modelu PCM
* Inne metody stosowane w teoretycznym opisie efektów rozpuszczalnikowych
|-  align="left"
| style="background-color:#F9F9F" width="100px" | '''11:00 - 11:15'''
| style="background-color:#F9F9F" colspan="4" | Przerwa kawowa
|-  align="left"
| style="background-color:#F9F9F" width="100px" | '''11:15 - 12:15'''
| style="background-color:#F9F9F" colspan="4" | Wykład – Fizykochemia ograniczonych przestrzeni:
* Modele teoretyczne stosowane w badaniach układów ograniczonych przestrzennie
* Struktura elektronowa układów molekularnych w ograniczeniu przestrzennym
|-  align="left"
| style="background-color:#F9F9F" width="100px" | '''12:15 - 13:15'''
| style="background-color:#F9F9F" colspan="4" | Przerwa obiadowa
|-  align="left"
| style="background-color:#F9F9F" width="100px" | '''13:15 - 15:15'''
| style="background-color:#F9F9F" colspan="4" | Część warsztatowa:
* Właściwości elektryczne molekuł
* Modelowanie ograniczenia przestrzennego
|-  align="left"
| style="background-color:#F9F9F" width="100px" | '''15:15 - 15:30'''
| style="background-color:#F9F9F" colspan="4" | Przerwa kawowa
|-  align="left"
| style="background-color:#F9F9F" width="100px" | '''15:30 - 17:00'''
| style="background-color:#F9F9F" colspan="4" | Czas pracy własnej
|- style="background-color:#D8D8D8;"
| colspan="5" align="left" style="font-size: 120%; font-variant: small-caps; font-weight: bold" | Piątek, 27 lutego 2015
|-  align="left"
| style="background-color:#F9F9F" width="100px" | '''10:00 - 11:00'''
| style="background-color:#F9F9F" colspan="4" | Wykład – Podstawy i możliwości aplikacyjne kwantowej teorii atomów w cząsteczkach::
* Gęstość elektronowa oraz jej gradient
* Parametry topologiczne punktów krytycznych pola skalarnego gęstości elektronowej
* Ścieżki wiązań, graf molekularny, baseny atomowe
* Przykłady aplikacji formalizmu QTAIM
|-  align="left"
| style="background-color:#F9F9F" width="100px" | '''11:00 - 11:15'''
| style="background-color:#F9F9F" colspan="4" | Przerwa kawowa
|-  align="left"
| style="background-color:#F9F9F" width="100px" | '''11:15 - 12:15'''
| style="background-color:#F9F9F" colspan="4" | Część warsztatowa:
* Przegląd i prezentacja funkcjonowania dostępnego oprogramowania:
AIMPAC, AIM2000, AIMAll
|-  align="left"
| style="background-color:#F9F9F" width="100px" | '''12:15 - 13:15'''
| style="background-color:#F9F9F" colspan="4" | Przerwa obiadowa
|-  align="left"
| style="background-color:#F9F9F" width="100px" | '''13:15 - 15:15'''
| style="background-color:#F9F9F" colspan="4" | Część warsztatowa:
* Lokalizacja punktów krytycznych na powierzchnie gęstości elektronowej modelowych układów
* Analiza parametrów topologicznych punktów krytycznych oraz basenów atomowych
|-  align="left"
| style="background-color:#F9F9F" width="100px" | '''15:15 - 15:30'''
| style="background-color:#F9F9F" colspan="4" | Przerwa kawowa
|-  align="left"
| style="background-color:#F9F9F" width="100px" | '''15:30 - 17:00'''
| style="background-color:#F9F9F" colspan="4" | Czas pracy własnej
|}

== Literatura pomocnicza ==
* J. Tomasi, B. Mennucci, R. Cammi ''Chem. Rev.'', 2005, '''105''', 2999–3094 ''"Quantum Mechanical Continuum Solvation Models"''
* L. Piela  ''"Idee chemii kwantowej"'' PWN, Warszawa - rozdział '''12''': ''Molekuła w polu elektrycznym i magnetycznym''
* R. Zaleśny, R. W. Góra, J. Kozłowska, J. M. Luis, H. Agren, W. Bartkowiak ''J. Chem. Theory Comput.'', 2013, '''9''', 3463–3472 ''"Resonant and non-resonant hyperpolarizabilities of spatially confined molecules: a case study of cyanoacetylene"''
* R. F. W. Bader ''Chem. Rev.'' 1991, '''91''', 893-928 ''"A Quantum Theory of Molecular Structure and Its Appllcatlons"''
[[Kategoria:Szkolenia]]