Gromacs: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
 
m (1 wersja: A-G)
(Brak różnic)

Wersja z 09:29, 18 sty 2010

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe

Gromacs.jpg

Gromacs - pakiet oprogramowania chemicznego przeznaczony do symulacji dynamiki molekularnej.

Informacje ogólne

Pakiet jest darmowy, rozpowszechniany na licencji GNU GPL.

Program zaprojektowany został z myślą o molekułach biochemicznych (np. proteiny, lipidy) ale z powodzeniem wykorzystywany jest także do badania systemów nie-biologicznych, np. polimerów.

Gromacs umożliwia obliczenia równoległe przy użyciu standardowych bibliotek MPI.

Dokumentacja

Na klastrze Nova dostępne są dwie wersje Gromacs-a 4.0.4. Jedna skompilowana z wykorzystaniem trybu float druga - double, obie korzystają z bibliotek mpi i sieci InfiniBand.

Programy znajdują się w katalogach:

/usr/local/gromacs-4.0.4/
/usr/local/gromacs-4.0.4-double/


Gromacs w sieci


Zobacz też: Oprogramowanie KDM