JMol-J

Z KdmWiki
Wersja z dnia 07:44, 3 cze 2014 autorstwa Justa (dyskusja | edycje) (→‎Korzystanie w WCSS)
(różn.) ← poprzednia wersja | przejdź do aktualnej wersji (różn.) | następna wersja → (różn.)
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
JMol
jomol.png
Serwer Wersja
UI-GUI 14.0.11
Kontakt
kdm@wcss.pl


JMol jest programem służącym do trójwymiarowej wizualizacji molekuł. Program obsługuje różne formaty plików, a wśród nich: Gaussian 94/98/03/09 output, GAMESS, Ghemical, HIN, Jaguar, MM1GP, MOL, MOLPRO, CIF/mmCIF, CML, CSF, CTFile, MOPAC 93/97/2002 output, NWCHEM, odydata, PDB, QOUT, SDF, SHELX, SMOL, spinput, xodydata, XYZ, XYZ+vib oraz XYZ-FAH. Program umożliwia analizę drgań oraz struktury cząsteczki (pomiary długości wiązań, kątów walencyjnych i dwuściennych), tworzenie animacji oraz eksportgrafiki do formatów jpg, .png, .ppm, .pdf i PovRay.

Korzystanie w WCSS

W celu uruchomienia programu JMol należy wywołać polecenie:

 jmol.sh

Dokumentacja