Kompilacja aplikacji na klastrze: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
Linia 18: Linia 18:
 
* [[Kompilacja aplikacji równoległych]]
 
* [[Kompilacja aplikacji równoległych]]
 
* [[Linkowanie z bibliotekami numerycznymi]]
 
* [[Linkowanie z bibliotekami numerycznymi]]
 +
* [[Korzystanie z modułów]]
  
 
[[Kategoria:Podręcznik użytkownika]]
 
[[Kategoria:Podręcznik użytkownika]]

Wersja z 10:25, 2 wrz 2011

< Podręcznik użytkownika KDM < Kompilacja aplikacji na klastrze

Użytkownik może kompilować swoje oprogramowanie zgodnie z regułami pracy na klastrze. Niedopuszczalna jest kompilacja na węźle dostępowym (supernova) lub po zalogowaniu przez SSH na dowolny z węzłów obliczeniowych.

Kompilację programu należy traktować jako jedno z zadań i wstawiać do jednej z kolejek systemu PBS. Najprościej jest zgłosić żądanie o dostęp do zasobów w trybie interaktywnym, wówczas system kolejkowy przydziela powłokę (shell) umożliwiając interaktywną pracę na węzłach obliczeniowych.

W tym celu należy wykonać polecenie (kolejki i wymagania są przykładowe):

  • zadanie interaktywne w kolejce domyślnej normal, z domyślnymi zasobami - 1 rdzeń i 2 GB pamięci RAM:
qsub -I -l software=gcc 
  • zadanie interaktywne w kolejce short6h, z zasobami - 1 rdzeń i 1 GB pamięci RAM:
qsub -I -l software=icc -l select=1:ncpus=1:mem=1000mb -q short6h 

Uwaga: Zadania kompilacji powinny być oznaczone parametrem -l software=nazwa_kompilatora.

Po przyznaniu zasobów i otrzymaniu powłoki należy przygotować swoje środowisko pracy do kompilacji korzystając z modułów.

Zobacz też: