Korzystanie z modułów: Różnice pomiędzy wersjami

Wersja z 13:50, 8 mar 2021

< Podręcznik użytkownika KDM < Korzystanie z modułów

Moduły

Moduł - moduły pozwalają na łatwą i szybką konfigurację środowiska sesji użytkownika. Każda wersja zainstalowanych na klastrze programów lub bibliotek produkcyjnych posiada własny moduł w formacie nazwa_aplikacji/wersja, np.gaussian/g09.E.01 . Moduły dodają odpowiednie zmienne środowiskowe lub podmieniają ich wartości. Do zmiennych środowiskowych należą standardowe w Linux-ach zmienne PATH oraz LD_LIBRARY_PATH, lecz także te, które są wyjątkowe dla aplikacji działających na klastrze.

!	Z mechanizmu należy korzystać na ui.wcss.pl lub węzłach roboczych - w zadaniach (czy to wsadowych czy interaktywnych).

Polecenie:

module avail - listuje dostępne moduły, polecana metoda do sprawdzenia zasobów oprogramowania

# wylistuj wszystkie dostępne moduly
module avail

# wylistuj dostępne moduły zawężając wyniki do Pythona:
module avail Python

module load [nazwa_modułu] - ładuje moduł [nazwa_modułu]

$ module load intel/12.1
 binutils/2.25 load complete.
 intel/12.1 load complete.

module list - wyświetla załadowane moduły

$ module list
Currently Loaded Modulefiles:
 1) binutils/2.25(default)   2) intel/12.1

module rm [nazwa_modułu] - usuwa załadowany moduł

$ module rm binutils
binutils/2.25 unload complete
$ module list
Currently Loaded Modulefiles:
 1) intel/12.1

module purge - usuwa wszystkie moduły

Nowe moduły [4.7]

Co zmieniają nowe moduły

Zmiana z wersji 3.2 (obecna) na 4.7 jest przeskokiem o kilka generacji programu i w związku z tym zmian jest bardzo wiele. Najbardziej zauważalne z punktu widzenia użytkownika to:

dużo szybsze działanie programu
jeżeli wynik polecenia nie mieści się na ekranie terminala jest przekierowywany do pagera (less)
nowy bardziej szczegółowy help
domyślny moduł jest podkreślony (po wywołaniu komendy `module avail`)
pokolorowany output

Listę zmian można zobaczyć na stronie: https://modules.readthedocs.io/en/latest/MIGRATING.html

Nowe argumenty polecenia module

Zaobserowane wady/zalety nowych modułów

Jak testować?

Jednorazowo

Wystarczy wykonać następujące polecenie:

. /usr/local/environmentmodules/4.7.0/init/profile.sh

Na stałe

Dodajemy na końcu swojego ~/.bashrc:

# use modules v4.7.0
source /usr/local/environmentmodules/4.7.0/init/bash

@@ Linia 10: / Linia 10: @@
   # wylistuj wszystkie dostępne moduly
   module avail
   # wylistuj dostępne moduły zawężając wyniki do Pythona:
   module avail Python
@@ Linia 28: / Linia 29: @@
 ) intel/12.1
 * '''module purge''' - usuwa wszystkie moduły
+=== Nowe moduły [4.7] ===
+==== Co zmieniają nowe moduły ====
+Zmiana z wersji 3.2 (obecna) na 4.7 jest przeskokiem o kilka generacji programu i w związku z tym zmian jest bardzo wiele.
+Najbardziej zauważalne z punktu widzenia użytkownika to:
+* dużo szybsze działanie programu
+* jeżeli wynik polecenia nie mieści się na ekranie terminala jest przekierowywany do pagera (less)
+* nowy bardziej szczegółowy help
+* domyślny moduł jest podkreślony (po wywołaniu komendy `module avail`)
+* pokolorowany output
+Listę zmian można zobaczyć na stronie:
+https://modules.readthedocs.io/en/latest/MIGRATING.html
+==== Nowe argumenty polecenia module ====
+==== Zaobserowane wady/zalety nowych modułów ====
+==== Jak testować? ====
+===== Jednorazowo =====
+Wystarczy wykonać następujące polecenie:
+ . /usr/local/environmentmodules/4.7.0/init/profile.sh
+===== Na stałe =====
+Dodajemy na końcu swojego ~/.bashrc:
+ # use modules v4.7.0
+ source /usr/local/environmentmodules/4.7.0/init/bash
 [[Kategoria:Podręcznik użytkownika]]