MOPAC: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
 
(Nie pokazano 5 wersji utworzonych przez 3 użytkowników)
Linia 1: Linia 1:
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]]</small>  
+
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < MOPAC</small>  
{{aplikacja|nazwa=MOPAC|logo=|serwer=[[Nova]]|wersja=2009}}
+
{{aplikacja|nazwa=MOPAC|logo=|serwer=[[Bem]]|wersja=2012}}
'''MOPAC2009''' - W aplikacji zaimplementowano półempiryczne metody chemii obliczeniowej, stosowane w przypadku układów, których liczenie tradycyjnymi metodami ab initio (HF,CCSD,CI itd.) byłoby zbyt kosztowne obliczeniowo.  
+
'''MOPAC''' - aplikacja, w której zaimplementowano półempiryczne metody chemii obliczeniowej, stosowane w przypadku układów, których liczenie tradycyjnymi metodami ''ab initio'' (HF, CCSD, CI itd.) byłoby zbyt kosztowne obliczeniowo.  
  
Metody w MOPAC2009:
+
=== MOPAC w WCSS ===
*[[MNDO]] - wersje : klasyczna [[MNDO]] i [[MNDO-d]]
+
Pakiet zainstalowany jest na klastrze [[Bem]].
*[[AM1]]
 
*[[PM3]]
 
*[[PM6]]
 
*[[MOZYME]]
 
  
 +
Testowe uruchomienia programu powinny być wykonywane jako [[PBS#Zadania_interaktywne|zadanie interaktywne]]:
 +
  qsub -I -l walltime=06:00:00 -l software=Mopac
 +
 +
Następnie program można uruchomić po wgraniu odpowiedniego [[modules|modułu]]:
 +
module load mopac
 +
 +
Program można wywoływać poleceniem:
 +
mopac plik.mop
 +
 +
<!--
 +
Zadania obliczeniowe wstawia się do kolejki wywołując:
 +
sub-mopac plik.mop [ pamiec ] [ kolejka ]
 +
 +
Domyślnie zadanie zostanie wstawione do kolejki <code>normal</code> z przydziałem 1 rdzenia i 1800MB pamięci.
 +
-->
 +
=== Informacje o wykorzystaniu ===
 +
{{Podziękowanie_WCSS}}
 +
=== MOPAC w sieci ===
 +
* [http://openmopac.net/ Strona domowa pakietu]
 +
 +
 +
{{Oprogramowanie}}
 
[[Kategoria:Oprogramowanie]]
 
[[Kategoria:Oprogramowanie]]
 
[[Kategoria:Podręcznik użytkownika]]
 
[[Kategoria:Podręcznik użytkownika]]

Aktualna wersja na dzień 15:22, 23 lut 2016

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < MOPAC

MOPAC
Serwer Wersja
Bem 2012
Kontakt
kdm@wcss.pl

MOPAC - aplikacja, w której zaimplementowano półempiryczne metody chemii obliczeniowej, stosowane w przypadku układów, których liczenie tradycyjnymi metodami ab initio (HF, CCSD, CI itd.) byłoby zbyt kosztowne obliczeniowo.

MOPAC w WCSS

Pakiet zainstalowany jest na klastrze Bem.

Testowe uruchomienia programu powinny być wykonywane jako zadanie interaktywne:

 qsub -I -l walltime=06:00:00 -l software=Mopac

Następnie program można uruchomić po wgraniu odpowiedniego modułu:

module load mopac

Program można wywoływać poleceniem:

mopac plik.mop

Informacje o wykorzystaniu

Wszelkie publikacje, (w tym prace doktorskie i dyplomowe) wykorzystujące wyniki obliczeń wykonanych na komputerach WCSS, powinny zawierać podziękowania postaci (odpowiednio do języka publikacji):

"Obliczenia wykonano na komputerach Wrocławskiego Centrum Sieciowo-Superkomputerowego (http://www.wcss.pl), grant obliczeniowy Nr ... "

"Calculations have been carried out in Wroclaw Centre for Networking and Supercomputing (http://www.wcss.pl), grant No. ..."

MOPAC w sieci