MOPAC: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
 
(Nie pokazano 1 wersji utworzonej przez jednego użytkownika)
Linia 1: Linia 1:
 
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < MOPAC</small>  
 
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < MOPAC</small>  
{{aplikacja|nazwa=MOPAC|logo=|serwer=[[Supernova]]|wersja=7.1}}
+
{{aplikacja|nazwa=MOPAC|logo=|serwer=[[Bem]]|wersja=2012}}
'''MOPAC2009''' - aplikacja, w której zaimplementowano półempiryczne metody chemii obliczeniowej, stosowane w przypadku układów, których liczenie tradycyjnymi metodami ''ab initio'' (HF, CCSD, CI itd.) byłoby zbyt kosztowne obliczeniowo.  
+
'''MOPAC''' - aplikacja, w której zaimplementowano półempiryczne metody chemii obliczeniowej, stosowane w przypadku układów, których liczenie tradycyjnymi metodami ''ab initio'' (HF, CCSD, CI itd.) byłoby zbyt kosztowne obliczeniowo.  
  
 
=== MOPAC w WCSS ===
 
=== MOPAC w WCSS ===
Pakiet zainstalowany jest na klastrze [[Supernova]].
+
Pakiet zainstalowany jest na klastrze [[Bem]].
  
 
Testowe uruchomienia programu powinny być wykonywane jako [[PBS#Zadania_interaktywne|zadanie interaktywne]]:
 
Testowe uruchomienia programu powinny być wykonywane jako [[PBS#Zadania_interaktywne|zadanie interaktywne]]:
   qsub -I -l software=Mopac
+
   qsub -I -l walltime=06:00:00 -l software=Mopac
  
 
Następnie program można uruchomić po wgraniu odpowiedniego [[modules|modułu]]:
 
Następnie program można uruchomić po wgraniu odpowiedniego [[modules|modułu]]:
Linia 15: Linia 15:
 
  mopac plik.mop
 
  mopac plik.mop
  
 +
<!--
 
Zadania obliczeniowe wstawia się do kolejki wywołując:
 
Zadania obliczeniowe wstawia się do kolejki wywołując:
 
  sub-mopac plik.mop [ pamiec ] [ kolejka ]  
 
  sub-mopac plik.mop [ pamiec ] [ kolejka ]  
  
 
Domyślnie zadanie zostanie wstawione do kolejki <code>normal</code> z przydziałem 1 rdzenia i 1800MB pamięci.
 
Domyślnie zadanie zostanie wstawione do kolejki <code>normal</code> z przydziałem 1 rdzenia i 1800MB pamięci.
 
+
-->
 +
=== Informacje o wykorzystaniu ===
 +
{{Podziękowanie_WCSS}}
 
=== MOPAC w sieci ===
 
=== MOPAC w sieci ===
 
* [http://openmopac.net/ Strona domowa pakietu]
 
* [http://openmopac.net/ Strona domowa pakietu]

Aktualna wersja na dzień 15:22, 23 lut 2016

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < MOPAC

MOPAC
Serwer Wersja
Bem 2012
Kontakt
kdm@wcss.pl

MOPAC - aplikacja, w której zaimplementowano półempiryczne metody chemii obliczeniowej, stosowane w przypadku układów, których liczenie tradycyjnymi metodami ab initio (HF, CCSD, CI itd.) byłoby zbyt kosztowne obliczeniowo.

MOPAC w WCSS

Pakiet zainstalowany jest na klastrze Bem.

Testowe uruchomienia programu powinny być wykonywane jako zadanie interaktywne:

 qsub -I -l walltime=06:00:00 -l software=Mopac

Następnie program można uruchomić po wgraniu odpowiedniego modułu:

module load mopac

Program można wywoływać poleceniem:

mopac plik.mop

Informacje o wykorzystaniu

Wszelkie publikacje, (w tym prace doktorskie i dyplomowe) wykorzystujące wyniki obliczeń wykonanych na komputerach WCSS, powinny zawierać podziękowania postaci (odpowiednio do języka publikacji):

"Obliczenia wykonano na komputerach Wrocławskiego Centrum Sieciowo-Superkomputerowego (http://www.wcss.pl), grant obliczeniowy Nr ... "

"Calculations have been carried out in Wroclaw Centre for Networking and Supercomputing (http://www.wcss.pl), grant No. ..."

MOPAC w sieci