Molden: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
Linia 17: Linia 17:
 
# uruchomić program poleceniem molden
 
# uruchomić program poleceniem molden
 
#:<pre>$ molden</pre>
 
#:<pre>$ molden</pre>
 +
 +
;Informacje o wykorzystaniu
 +
{{Podziękowanie_WCSS}}
  
 
;Molden w sieci
 
;Molden w sieci

Wersja z 11:58, 21 lip 2014

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Molden

Molden
Molden.gif
Serwer Wersja
Supernova 5.0
Kontakt
kdm@wcss.pl

Molden - program do pre- i postprocessingu struktur molekularnych.

Główne zastosowania
  • Czytanie outputu z programów chemicznych takich jak Gaussian, Gamess i Molpro.
  • Tworzenie graficznego formatu orbitali molekularnych i gęstości molekularnej.
  • Animacja ścieżki reakcji.
  • Zaawansowany edytor Z-Matrix.
Aby uruchomić Moldena na Supernovej należy
  1. zalogować się z przekierowaniem wyświetlania
  2. wstawić graficzne zadanie interaktywne
    $ qsub -I -X -l software=Molden
  3. załadować moduł molden
    $ module load molden
  4. uruchomić program poleceniem molden
    $ molden
Informacje o wykorzystaniu

Wszelkie publikacje, (w tym prace doktorskie i dyplomowe) wykorzystujące wyniki obliczeń wykonanych na komputerach WCSS, powinny zawierać podziękowania postaci (odpowiednio do języka publikacji):

"Obliczenia wykonano na komputerach Wrocławskiego Centrum Sieciowo-Superkomputerowego (http://www.wcss.pl), grant obliczeniowy Nr ... "

"Calculations have been carried out in Wroclaw Centre for Networking and Supercomputing (http://www.wcss.pl), grant No. ..."

Molden w sieci

Zobacz też : oprogramowanie KDM