Molden-J: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
(Utworzono nową stronę "'''Molden''' jest darmowym programem przeznaczonym do przygotowywania struktur badanych związków i analizy wyników uzyskanych za pomocą takich pakietów jak: GAMESS ...")
 
 
(Nie pokazano 12 pośrednich wersji utworzonych przez tego samego użytkownika)
Linia 1: Linia 1:
'''Molden''' jest darmowym programem przeznaczonym do przygotowywania struktur badanych związków i analizy wyników uzyskanych za pomocą takich pakietów jak: GAMESS UK, GAMESS US, Gaussian, Molpro, Molcas, Jaguar, ADF, Dalton, Mopac/Ampac. Za pomocą tego programu możemy wyświetlać strukture związków, drogę optymalizacji, orbitale molekularne, gęstość elektronową, potencjał elektrostatyczny (ESP), moment dipolowy, a także ładunki Mullikena. Oprogramowanie to umożliwia również śledzenie ścieżki reakcji chemicznych (IRC) oraz wizualizację drgań cząsteczki. Program ma możliwość optymalizacji geometrii, posiada własne pole siłowe – ambfor, które może w połączeniu z polami siłowymi Amber (dla białek) oraz garfla (dla małych cząsteczek) wykorzystać do optymalizacji. Niewątpliwie jedną z największych zalet programu jest rozbudowany edytor Z-macierzy, który daje pełną kontrolę geometrii cząsteczki i pozwala budować molekuły od podstaw, a także korzystać z bibliotek struktur. Za pomocą programu można również tworzyć różnego rodzaju instrukcje graficzne, np.: PostScript, X-Window, VRML, PovRay, OpenGL.
+
{{aplikacja|nazwa=Molden|logo=[[Plik:molden-1.png|250px]]|serwer=[[UI-GUI]] |wersja=5.0.6}}
 +
 
 +
'''Molden''' jest programem przeznaczonym do przygotowywania struktur badanych związków i analizy wyników uzyskanych za pomocą takich pakietów jak: Gaussian, GAMESS UK, GAMESS US, Molpro, Molcas, ADF, Dalton, Mopac/Ampac. Oprogramowanie to umożliwia wyświetlanie struktury związków, drogi optymalizacji, orbitali molekularnych, gęstości elektronowej, potencjału elektrostatycznego (ESP), momentu dipolowego, ładunków Mullikena, ścieżek reakcji chemicznych (IRC) oraz wizualizację drgań cząsteczki. Dużą zaletą programu jest rozbudowany edytor Z-macierzy, który umożliwia budowanie molekuły od podstaw, a także korzystanie z bibliotek struktur. Za pomocą programu można również tworzyć różnego rodzaju instrukcje graficzne, np.: PostScript, X-Window, VRML, PovRay, OpenGL.
 +
 
 +
===Korzystanie w WCSS===
 +
W celu uruchomienia programu Molden należy wywołać polecenie:
 +
  molden
 +
 
 +
===Dokumentacja===
 +
*[http://www.cmbi.ru.nl/molden/molden.html Strona domowa programu Molden]

Aktualna wersja na dzień 13:11, 4 cze 2014

Molden
molden-1.png
Serwer Wersja
UI-GUI 5.0.6
Kontakt
kdm@wcss.pl


Molden jest programem przeznaczonym do przygotowywania struktur badanych związków i analizy wyników uzyskanych za pomocą takich pakietów jak: Gaussian, GAMESS UK, GAMESS US, Molpro, Molcas, ADF, Dalton, Mopac/Ampac. Oprogramowanie to umożliwia wyświetlanie struktury związków, drogi optymalizacji, orbitali molekularnych, gęstości elektronowej, potencjału elektrostatycznego (ESP), momentu dipolowego, ładunków Mullikena, ścieżek reakcji chemicznych (IRC) oraz wizualizację drgań cząsteczki. Dużą zaletą programu jest rozbudowany edytor Z-macierzy, który umożliwia budowanie molekuły od podstaw, a także korzystanie z bibliotek struktur. Za pomocą programu można również tworzyć różnego rodzaju instrukcje graficzne, np.: PostScript, X-Window, VRML, PovRay, OpenGL.

Korzystanie w WCSS

W celu uruchomienia programu Molden należy wywołać polecenie:

 molden

Dokumentacja