NBO: Różnice pomiędzy wersjami
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
| Linia 1: | Linia 1: | ||
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < NBO</small> | <small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < NBO</small> | ||
{{aplikacja|nazwa=NBO|serwer=[[Supernova]]|wersja=6.0}} | {{aplikacja|nazwa=NBO|serwer=[[Supernova]]|wersja=6.0}} | ||
| + | === NBO === | ||
| + | |||
| + | Program NBO analizuje wieloelektronową funkcję falową pod względem lokalizacji par elektronowych cząsteczki. Wykorzystuje rozkład gęstości elektronowej, w celu określenia najbardziej trafnej struktóry Lewisa. | ||
| + | |||
| + | Program przeprowadza determinację: | ||
| + | * Naturalnego orbitala atomowego (NAOs) | ||
| + | * Naturalnego orbitala hybrydowego (NHOs) | ||
| + | * Naturalnego orbitala wiążącego (NBOs) | ||
| + | * Naturalnie zlokalizowanego orbitala molekularnego (NLMOs) | ||
=== Wstawianie zadań === | === Wstawianie zadań === | ||
Wersja z 08:07, 15 lip 2014
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < NBO
| NBO | |
|---|---|
| Serwer | Wersja |
| Supernova | 6.0 |
| Kontakt | |
| kdm@wcss.pl | |
NBO
Program NBO analizuje wieloelektronową funkcję falową pod względem lokalizacji par elektronowych cząsteczki. Wykorzystuje rozkład gęstości elektronowej, w celu określenia najbardziej trafnej struktóry Lewisa.
Program przeprowadza determinację:
- Naturalnego orbitala atomowego (NAOs)
- Naturalnego orbitala hybrydowego (NHOs)
- Naturalnego orbitala wiążącego (NBOs)
- Naturalnie zlokalizowanego orbitala molekularnego (NLMOs)
Wstawianie zadań
- użycie NBO wymaga załadowania modułu w skrypcie zadania lub z linii poleceń w trakcie zadania interaktywnego:
module load nbo/6.0
- użycie NBO wraz z Gaussianem 2009 D.01 wymaga załadowania innego modułu i następnie uruchomienie g09. Zalecane jest użycie zadania interaktywnego. Jeśli zadanie g09 wymaga podania liczby procesorów lub wielkości pamięci innych niż domyślne, to należy dodać odpowiednie karty %nproc i %mem do pliku danych g09.
module load nbo/6.0-g09 g09 plik_danych.inp plik_wynikow.log
- użycie NBO wraz z GAMESS'em 2013 możliwe jest poprzez zlecenie zadania przy użyciu jednego z następujących skryptów:
sub-gamess lub sub-gamess-2013.05.01-R1
| Oprogramowanie naukowe |
Abaqus ⋅ ABINIT ⋅ ADF ⋅ Amber ⋅ ANSYS [ ANSYS CFD: Fluent, CFX, ICEM; Mechanical ] ⋅ AutoDock ⋅ BAGEL ⋅ Beast ⋅ Biovia [ Materials Studio, Discovery Studio ] ⋅ Cfour ⋅ Comsol ⋅ CP2K ⋅ CPMD ⋅ CRYSTAL ⋅ Dalton ⋅ Dask ⋅ DIRAC ⋅ FDS-SMV ⋅ GAMESS ⋅ Gaussian ⋅ Gromacs ⋅ IDL ⋅ Lumerical [ FDTD, MODE ] ⋅ Mathcad ⋅ Mathematica⋅ Matlab ⋅ Molcas ⋅ Molden ⋅ Molpro ⋅ MOPAC ⋅ NAMD ⋅ NBO ⋅ NWChem ⋅ OpenFOAM ⋅ OpenMolcas ⋅ Orca ⋅ Quantum ESPRESSO ⋅ R ⋅ Rosetta ⋅ SIESTA ⋅ Tinker ⋅ TURBOMOLE ⋅ VASP ⋅ VMD ⋅ WIEN2k |
|---|