NWChem: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
m (1 wersja)
 
Linia 7: Linia 7:
  
 
== Korzystanie z pakietu w WCSS ==
 
== Korzystanie z pakietu w WCSS ==
 +
Obecnie zainstalowaną wersją pakietu NWChem jest '''ver. 5.1''', skompilowana przy użyciu [[Global Arrays toolkit]] ver 4.1b.
 +
 
Obliczenia uruchamia się poleceniem:
 
Obliczenia uruchamia się poleceniem:
  
  > sub-nwchem plik_zadania.nw nazwa_kolejki ilość_procesorów ilość_pamięci_do_alokacji
+
  > sub-nwchem plik_danych.nw kolejka liczba_procesorow pamięc-w-MB
  
np.  
+
gdzie:
 +
* plik_danych.inp - plik z danymi programu
 +
* kolejka - kolejka PBS, w której ma być uruchomione zadanie (domyślnie parallel)
 +
* liczba_procesorow - domyślnie zadanie uruchamiane jest na 4 procesorach, jeśli parametr ten jest podany, jego wartość powinna być wielokrotnością 4.
 +
* pamiec-w-MB - pamięć operacyjna dla całego zadania, musi być podana w MB.
 +
 
 +
Przykład uruchomienia (kolejka parallel, zadanie 4 procesorowe, z pamięcią 7 GB):
  
 
  > sub-nwchem test.nw parallel 4 7000
 
  > sub-nwchem test.nw parallel 4 7000
 
== Wersja Pakietu ==
 
Obecnie zainstalowaną wersją pakietu NWChem jest '''ver. 5.1''', skompilowana przy użyciu [[Global Arrays toolkit]] ver 4.1b.
 
  
  

Wersja z 11:48, 4 mar 2010

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe

NWCHEM jest pakietem do obliczeń metodą ab initio w dziedzinie chemii molekuralnej. Program rozwijany jest przez Molecular Sciences Software group of the Environmental Molecular Sciences Laboratory (EMSL) w Pacific Northwest National Laboratory (PNNL).

Informacje ogólne

Opis funkcjonalności znajduje się na stronie domowej projektu: NWChem Home Page

Korzystanie z pakietu w WCSS

Obecnie zainstalowaną wersją pakietu NWChem jest ver. 5.1, skompilowana przy użyciu Global Arrays toolkit ver 4.1b.

Obliczenia uruchamia się poleceniem:

> sub-nwchem plik_danych.nw kolejka liczba_procesorow pamięc-w-MB

gdzie:

  • plik_danych.inp - plik z danymi programu
  • kolejka - kolejka PBS, w której ma być uruchomione zadanie (domyślnie parallel)
  • liczba_procesorow - domyślnie zadanie uruchamiane jest na 4 procesorach, jeśli parametr ten jest podany, jego wartość powinna być wielokrotnością 4.
  • pamiec-w-MB - pamięć operacyjna dla całego zadania, musi być podana w MB.

Przykład uruchomienia (kolejka parallel, zadanie 4 procesorowe, z pamięcią 7 GB):

> sub-nwchem test.nw parallel 4 7000


Zobacz też: Oprogramowanie KDM