Rosetta: Różnice pomiędzy wersjami
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
| Linia 1: | Linia 1: | ||
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < Rosetta</small> | <small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < Rosetta</small> | ||
{{aplikacja|nazwa=Rosetta|logo=[[Plik:rosetta.png|noframe|center]]|serwer=[[Supernova]]|wersja=3.2.1}} | {{aplikacja|nazwa=Rosetta|logo=[[Plik:rosetta.png|noframe|center]]|serwer=[[Supernova]]|wersja=3.2.1}} | ||
| − | == Rosetta == | + | === Rosetta === |
Program Rosetta służy do modelowania struktóry białek. | Program Rosetta służy do modelowania struktóry białek. | ||
Zaawansowany algorytm umożliwia tworzenie białek,enzymów de novo,łączenie ligandów oraz przewidywanie struktury złożonych kompleksów. | Zaawansowany algorytm umożliwia tworzenie białek,enzymów de novo,łączenie ligandów oraz przewidywanie struktury złożonych kompleksów. | ||
| − | == Licencja == | + | === Licencja === |
Program Rosetta jest dostepny dla komercyjnych i niekomercyjnych użytkownikóœ za darmo. Licencje można uzyskać na stronie [https://www.rosettacommons.org/software/license-and-download Licencja ] | Program Rosetta jest dostepny dla komercyjnych i niekomercyjnych użytkownikóœ za darmo. Licencje można uzyskać na stronie [https://www.rosettacommons.org/software/license-and-download Licencja ] | ||
| Linia 17: | Linia 17: | ||
> module load rosetta/3.2.1 (dla wersji domyślnej - najnowszej) | > module load rosetta/3.2.1 (dla wersji domyślnej - najnowszej) | ||
| − | == Rosetta w sieci == | + | === Rosetta w sieci === |
*[https://www.rosettacommons.org/software Strona domowa] | *[https://www.rosettacommons.org/software Strona domowa] | ||
Wersja z 12:22, 22 lip 2014
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Rosetta
| Rosetta | |
|---|---|
 | |
| Serwer | Wersja |
| Supernova | 3.2.1 |
| Kontakt | |
| kdm@wcss.pl | |
Rosetta
Program Rosetta służy do modelowania struktóry białek. Zaawansowany algorytm umożliwia tworzenie białek,enzymów de novo,łączenie ligandów oraz przewidywanie struktury złożonych kompleksów.
Licencja
Program Rosetta jest dostepny dla komercyjnych i niekomercyjnych użytkownikóœ za darmo. Licencje można uzyskać na stronie Licencja
Środowisko i praca interaktywna
Praca z pakietem w trybie interaktywnym jest możliwa po uruchomieniu zadania interaktywnego w jednej z kolejek PBS, np:
> qsub -I -q short6h
Środowisko programu inicjalizowane jest w powłoce przez polecenie:
> module load rosetta/3.2.1 (dla wersji domyślnej - najnowszej)