Szkolenie Turbomole/EGEE

Z KdmWiki
Skocz do: nawigacji, wyszukiwania

Tematy:

  • Turbomole - 15 maja, godz. 9:15
  • EGEE - 16 maja, godz. 8:15


Prowadzący: Mariusz Sterzel <m.sterzel@cyfronet.pl>, Akademickie Centrum Komputerowe CYFRONET, Akademia Górniczo Hutnicza


Miejsce: budynek D2, pok. 107A, na tym samym poziomie co WCSS, wejście za schodami.


I. Wprowadzenie do obliczeń pakietem TURBOMOLE

  1. Przegląd możliwości pakietu (30-40')
  2. Instalacja i konfiguracja. Omówienie praktycznych aspektów obliczeń (20')
  3. Przygotowanie plików inputowych – obsługa generatora “define” (20' + 1.0 godz)
  4. Ideologia TURBOMOLE – przykładowe obliczenia (optymalizacja geometrii, drgania normalne, obliczenia z rozpuszczalnikiem, TDDFT, CC2) (15' + 1.5 godz)
  5. Dane wynikowe i ich wizualizacja (15' + 45')

Materiały: Inform. Ogólne Cwiczenia Język JDL

II. Wstęp do obliczeń na gridzie z wykorzystaniem EGEE Grid

  1. Wprowadzenie (40')
  2. Dostęp do zasobów gridowych (20')
  3. Praca z gridem. Przygotowanie skryptów i uruchamianie zadań (30' + 1.5godz)
    1. wprowadzenie do języka opisu zadań
    2. zarządzanie zadaniami
  4. Składowanie i dostęp do danych na gridzie (30' + 1godz)
  5. Oprogramowanie chemiczne na przykładzie Gaussian VO (20')
  6. Portowanie własnych aplikacji na grid (30') – jak będą chętni/czasu wystarczy

Materiały: Wstęp Moduł Define

Lista uczestników

  • T - tylko Turbomole
  • E - tylko EGEE

Ze względu na ograniczoną liczbę komputerów przewiduje się pracę w zespołach dwuoosobowych

Lista uczestników:

  1. Sobieslaw Bąkowski
  2. Slawomir Berski
  3. Dariusz Bieńko
  4. Andrzej Bil
  5. Karolina Bober
  6. Przemyslaw Dopieralski
  7. Piotr Durlak
  8. Zygmunt Flisak
  9. Jerzy Hładyszowski
  10. Pawel Kusion
  11. Karol Langner
  12. Piotr Lodowski (T)
  13. Krzysztof Mierzwicki
  14. Paweł Misiak (T)
  15. Jerzy Moc
  16. Marek Naryniecki
  17. Arkadiusz Pacha (T)
  18. Paweł Panek
  19. Robert Wieczorek
  20. Wiktor Zierkiewicz
  21. Piotr Wojciechowski
  22. Marcin Selent (T)
  23. Bartłomiej Balcerek (E)
  24. Wojciech Kolodziejczyk (T)
  25. Maciej Dyczkowski (E)
  26. Agnieszka Kwiecień (E)
  27. Paweł Dziekoński