Biovia: Różnice pomiędzy wersjami
| Linia 51: | Linia 51: | ||
* [http://www.accelrys.com/catalyst/index.html Catalyst] | * [http://www.accelrys.com/catalyst/index.html Catalyst] | ||
* [http://www.icm.edu.pl/kdm/Accelrys Strona Accelrysa w ICM] | * [http://www.icm.edu.pl/kdm/Accelrys Strona Accelrysa w ICM] | ||
| − | * [http://www.icm.edu.pl/kdm/Accelrys: | + | * [http://www.icm.edu.pl/kdm/Accelrys:_NoweZasady1011 Informacje o licencji krajowej] |
* [http://www.accelrys.com/eflash/ Biuletyn Accelrys eFlash] | * [http://www.accelrys.com/eflash/ Biuletyn Accelrys eFlash] | ||
Wersja z 07:43, 4 paź 2010
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe
|
Accelrys (do 1 czerwca 2001 MSI, Molecular Simulations Inc.) - firma będąca jednym z największych dostawców oprogramowania naukowego z dziedziny modelowania molekularnego. Udostępnia oprogramowanie na platformy UNIX oraz PC/Windows.
Pakiety
Niektóre z dostępnych pakietów:
- Catalyst
- Cerius2
- Charmm - w bieżacym roku akademickim jest dostępna licencja Charmm w ramach licencji Accelrys. Zespoły badawcze mogą zakupić własne licencje aktualnej wersji Charmm.
- Insight II
- Quanta
- Materials Studio
- Discovery Studio
Licencja krajowa
Zasady korzystania
Krajową licencję na produkty firmy Accelrys udostępnia ICM. Informacje o licencji na rok akademicki 2009/2010 są dostępne na stronie:
Z akademickiej licencji krajowej mogą korzystać w WCSS tylko zespoły badawcze (kierownik może włączyć do zespołu np. zaawansowanego studenta). Do zajęć dydaktycznych należy używać licencji edukacyjnej - w tej sprawie prowadzący zajęcia powinni kontaktować się z ICM, WCSS jedynie może udostępnić komputer Leo.
Obowiązkowa ankieta
Osoby, które korzystają z oprogramowania Accelrys zobowiązane są do wypełnienia ankiety i wysłania jej pod adres: accelrys@icm.edu.pl
Informacja o wykorzystaniu
Uprzejmie przypominamy o konieczności zamieszczania w artykułach informacji o wykorzystaniu krajowej licencji Accelrys. Oryginalne sformułowanie umowy brzmi:
- "To acknowledge use of the country-wide license in every scientific paper where the software in the Country wide license is used".
Uprzejmie przypominamy, że do końca stycznia każdego roku kierownicy grantów powinni dostarczyć do WCSS sprawozdania, w tym kopie artykułów, w których wykorzystano oprogramowanie Accelrys lub wyjaśnienie dlaczego, mimo wykorzystania licencji, takie publikacje nie powstały.
Accelrys w WCSS
W WCSS pakiety firmy Accelrys dostępne są na serwerach Tezro, Leo i Nova. Aby praca z pakietami była możliwa (zarówno zdalna jak i lokalna) muszą być spełnione dwa podstawowe warunki:
- Połączenie sieciowe między Tezro/Leo/Nova a serwerem licencji w ICM (Warszawa) jest aktywne.
- Dostępna jest dostateczna ilość żetonów (ang. token) do uruchomienia pakietu/modułu.
- Wstawianie zadań do kolejki
Zadania należy uruchamiać posługując się poleceniem PBS qsub, bliżej omówionym w artykule System kolejkowania.
Dokumentacja
Dokumentacja w formie książkowej dostępna jest w WCSS, pok. 6. WCSS posiada także dostęp do dokumentacji najnowszych wersji produktów w postaci elektronicznej (pdf), aby z nich skorzystać prosimy o kontakt z administratorami.
Accelrys w sieci:
- Strona główna firmy Accelrys
- Insight II
- Cerius2
- Quanta
- Catalyst
- Strona Accelrysa w ICM
- Informacje o licencji krajowej
- Biuletyn Accelrys eFlash
Zobacz też: Oprogramowanie KDM
| Oprogramowanie naukowe |
Biovia | Discovery Studio ⋅ Materials Studio [ CASTEP ] |
|---|
| Oprogramowanie naukowe |
Abaqus ⋅ ABINIT ⋅ ADF ⋅ Amber ⋅ ANSYS [ ANSYS CFD: Fluent, CFX, ICEM; Mechanical ] ⋅ AutoDock ⋅ BAGEL ⋅ Beast ⋅ Biovia [ Materials Studio, Discovery Studio ] ⋅ Cfour ⋅ Comsol ⋅ CP2K ⋅ CPMD ⋅ CRYSTAL ⋅ Dalton ⋅ Dask ⋅ DIRAC ⋅ FDS-SMV ⋅ GAMESS ⋅ Gaussian ⋅ Gromacs ⋅ IDL ⋅ Lumerical [ FDTD, MODE ] ⋅ Mathcad ⋅ Mathematica⋅ Matlab ⋅ Molcas ⋅ Molden ⋅ Molpro ⋅ MOPAC ⋅ NAMD ⋅ NBO ⋅ NWChem ⋅ OpenFOAM ⋅ OpenMolcas ⋅ Orca ⋅ Quantum ESPRESSO ⋅ R ⋅ Rosetta ⋅ SIESTA ⋅ Tinker ⋅ TURBOMOLE ⋅ VASP ⋅ VMD ⋅ WIEN2k |
|---|