MOLCAS: Różnice pomiędzy wersjami
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
(-leo) |
|||
| Linia 1: | Linia 1: | ||
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]]</small> | <small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]]</small> | ||
| − | {{aplikacja|nazwa=Molcas|logo=[[Plik:molcas.jpg|120px]] | + | {{aplikacja|nazwa=Molcas|logo=[[Plik:molcas.jpg|120px]]|serwer=[[Supernova]]|wersja=7.6}} |
'''Molcas''' - oprogramowanie kwantowo-chemiczne. | '''Molcas''' - oprogramowanie kwantowo-chemiczne. | ||
| Linia 7: | Linia 7: | ||
== Korzystanie w WCSS == | == Korzystanie w WCSS == | ||
| − | Na klastrze [[Supernova]] dostępna jest wersja '''7.6''' (sekwencyjna i równoległa | + | Na klastrze [[Supernova]] dostępna jest wersja '''7.6''' (sekwencyjna i równoległa). |
| − | ;Uruchamianie | + | ;Uruchamianie zadań |
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
Zadanie wstawiamy skryptem '''sub-molcas76'''. | Zadanie wstawiamy skryptem '''sub-molcas76'''. | ||
| Linia 25: | Linia 15: | ||
plik.inp - plik z danymi wejściowymi, wyniki w plik.log | plik.inp - plik z danymi wejściowymi, wyniki w plik.log | ||
| − | Uwagi | + | ;Uwagi |
Zmienna MOLCASMEM przydzielana jest w ten sposób, że stanowi ok. 83% zadeklarowanej wartości w systemie PBS. Czyli jeśli podamy 1800mb per węzeł, MOLCASMEM przyjmie wartość 1500mb. Skrypt automatycznie sumuje ilość pamięci na węźle i modyfikuje MOLCASMEM. | Zmienna MOLCASMEM przydzielana jest w ten sposób, że stanowi ok. 83% zadeklarowanej wartości w systemie PBS. Czyli jeśli podamy 1800mb per węzeł, MOLCASMEM przyjmie wartość 1500mb. Skrypt automatycznie sumuje ilość pamięci na węźle i modyfikuje MOLCASMEM. | ||
Wersja z 13:22, 24 wrz 2012
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe
| Molcas | |
|---|---|
| 120px | |
| Serwer | Wersja |
| Supernova | 7.6 |
| Kontakt | |
| kdm@wcss.pl | |
Molcas - oprogramowanie kwantowo-chemiczne.
Licencja
WCSS posiada licencję na pakiet w wersji 6 i 7.
Korzystanie w WCSS
Na klastrze Supernova dostępna jest wersja 7.6 (sekwencyjna i równoległa).
- Uruchamianie zadań
Zadanie wstawiamy skryptem sub-molcas76.
$ sub-molcas76 plik.inp liczba_wezlow liczba_rdzeni_per_wezel pamiec_w_MB_per_wezel kolejka plik.inp - plik z danymi wejściowymi, wyniki w plik.log
- Uwagi
Zmienna MOLCASMEM przydzielana jest w ten sposób, że stanowi ok. 83% zadeklarowanej wartości w systemie PBS. Czyli jeśli podamy 1800mb per węzeł, MOLCASMEM przyjmie wartość 1500mb. Skrypt automatycznie sumuje ilość pamięci na węźle i modyfikuje MOLCASMEM.
Dokumentacja
- Molcas w sieci
Zobacz też: Oprogramowanie KDM
| Oprogramowanie naukowe |
Abaqus ⋅ ABINIT ⋅ ADF ⋅ Amber ⋅ ANSYS [ ANSYS CFD: Fluent, CFX, ICEM; Mechanical ] ⋅ AutoDock ⋅ BAGEL ⋅ Beast ⋅ Biovia [ Materials Studio, Discovery Studio ] ⋅ Cfour ⋅ Comsol ⋅ CP2K ⋅ CPMD ⋅ CRYSTAL ⋅ Dalton ⋅ Dask ⋅ DIRAC ⋅ FDS-SMV ⋅ GAMESS ⋅ Gaussian ⋅ Gromacs ⋅ IDL ⋅ Lumerical [ FDTD, MODE ] ⋅ Mathcad ⋅ Mathematica⋅ Matlab ⋅ Molcas ⋅ Molden ⋅ Molpro ⋅ MOPAC ⋅ NAMD ⋅ NBO ⋅ NWChem ⋅ OpenFOAM ⋅ OpenMolcas ⋅ Orca ⋅ Quantum ESPRESSO ⋅ R ⋅ Rosetta ⋅ SIESTA ⋅ Tinker ⋅ TURBOMOLE ⋅ VASP ⋅ VMD ⋅ WIEN2k |
|---|