Bem: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Skocz do: nawigacji, wyszukiwania
Linia 17: Linia 17:
 
* przestrzeń na katalogi domowe użytkowników: 11 TB NFS /home,  
 
* przestrzeń na katalogi domowe użytkowników: 11 TB NFS /home,  
 
* przestrzeń tymczasowa: 1,1 PB Lustre,
 
* przestrzeń tymczasowa: 1,1 PB Lustre,
* sieć obliczeniowa: Infiniband FDR, przepływność 56 Gbps (współczynnik blokowania 3:1),
+
* sieć obliczeniowa: Infiniband FDR, przepływność 56 Gbps (topologia fat-tree, współczynnik blokowania 3:1),
 
* sieć zarządzania: Ethernet 1G/10G,
 
* sieć zarządzania: Ethernet 1G/10G,
 
* system operacyjny: ScientificLinux 6.6,
 
* system operacyjny: ScientificLinux 6.6,
Linia 24: Linia 24:
 
=== Oprogramowanie ===
 
=== Oprogramowanie ===
 
;Aplikacje
 
;Aplikacje
[[Abaqus]], [[Abinit]], [[ADF]], [[ANSYS CFX]], [[ANSYS Fluent]], [[CP2K]], [[CPMD]], [[CRYSTAL09]], [[Dalton]], [[Gaussian]], [[GAMESS]], [[Gromacs]], [[LAMMPS]], [[Mathematica]], [[Matlab]], [[Molcas]], [[Molpro]], [[NWChem]], [[Orca]], [[R]], [[Siesta]], [[TURBOMOLE]], aplikacje własne użytkowników.
+
[[Abaqus]], [[Abinit]], [[ADF]], [[ANSYS CFX]], [[ANSYS Fluent]], [[CP2K]], [[CPMD]], [[CRYSTAL09]], [[Dalton]], [[Gaussian]], [[GAMESS]], [[Gromacs]], [[LAMMPS]], [[Mathematica]], [[Matlab]], [[Molcas]], [[Molpro]], [[NWChem]], [[Orca]], [[R]], [[Siesta]], [[TURBOMOLE]] i [[Oprogramowanie_naukowe|inne]] oraz aplikacje własne użytkowników.
  
 
;Kompilatory
 
;Kompilatory
[[GNU GCC]], [[Intel]], [[PGI]].
+
[[GNU GCC]], [[Intel]], [[PGI]] i [[Oprogramowanie_systemowe_i_narzędziowe|inne]].
  
 
;Biblioteki i narzędzia
 
;Biblioteki i narzędzia
Linia 33: Linia 33:
 
* HDF, HDF5,
 
* HDF, HDF5,
 
* NetCDF,
 
* NetCDF,
* Python + SciPy + NumPy.
+
* Python + SciPy + NumPy,
 +
* [[Oprogramowanie_systemowe_i_narzędziowe|pozostałe]].
  
 
;System kolejkowania  
 
;System kolejkowania  

Wersja z 12:54, 20 sty 2016

< Podręcznik użytkownika KDM < Maszyny obliczeniowe < Bem

Bem
noframe
Kontakt
kdm@wcss.pl

Bem - klaster zainstalowany w WCSS w marcu 2015 r. Architektura wszystkich komputerów to x86_64 z procesorami Intel Xeon E5-2670v3 (mikroarchitektura Haswell).

Parametry klastra

  • węzeł dostępowy: bem.wcss.pl,
  • 720 węzłów obliczeniowych 24-rdzeniowych,
  • 192 węzły obliczeniowe 28-rdzeniowe,
  • 22 656 rdzeni obliczeniowych,
  • 76,5 TB pamięci RAM (64, 128 lub 512 GB/węzeł),
  • przestrzeń na katalogi domowe użytkowników: 11 TB NFS /home,
  • przestrzeń tymczasowa: 1,1 PB Lustre,
  • sieć obliczeniowa: Infiniband FDR, przepływność 56 Gbps (topologia fat-tree, współczynnik blokowania 3:1),
  • sieć zarządzania: Ethernet 1G/10G,
  • system operacyjny: ScientificLinux 6.6,
  • moc obliczeniowa: 860 TFLOPS.

Oprogramowanie

Aplikacje

Abaqus, Abinit, ADF, ANSYS CFX, ANSYS Fluent, CP2K, CPMD, CRYSTAL09, Dalton, Gaussian, GAMESS, Gromacs, LAMMPS, Mathematica, Matlab, Molcas, Molpro, NWChem, Orca, R, Siesta, TURBOMOLE i inne oraz aplikacje własne użytkowników.

Kompilatory

GNU GCC, Intel, PGI i inne.

Biblioteki i narzędzia
  • OpenMPI,
  • HDF, HDF5,
  • NetCDF,
  • Python + SciPy + NumPy,
  • pozostałe.
System kolejkowania

PBSPro.

Zobacz też