Beast

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
The printable version is no longer supported and may have rendering errors. Please update your browser bookmarks and please use the default browser print function instead.

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Beast

Beast
beast.png
Serwer Wersja
Bem 2.5.1
Kontakt
kdm@wcss.pl


Beast - program do Bayesowskiej analizy filogenetycznej sekwencji molekularnych, jest opracowywany przez zespół naukowców z całego świata.


Licencja

Program jest udostępniany na licencji GNU Lesser General Public License.

Korzystanie w WCSS

Beast dostępny jest na klastrze Bem w katalogu /usr/local/beast/ w wersji 2.5.1.

/usr/local/beast/
`-- 2.5.1/
    `-- with_jre1.8.0_161/
        |-- LICENSE.txt
        |-- README.txt
        |-- VERSION\ HISTORY.txt
        |-- bin/
        |-- examples/
        |-- images/
        |-- jre1.8.0_161/
        |-- lib/
        `-- templates/

Środowisko

Środowisko programu należy uruchomić wykonując polecenie:

> module load beast/2.5.1-with_JRE

lub w skrócie:

> module load beast

Jak korzystać

Lista dostępnych opcji:

> beast -help

Beast2 używa formatu wejściowego XML.

Beast2 jest kompatybilny z bibliotekami beagle-lib, które również są dostępne na klastrze Bem.

Biblioteka beagle/3.0.2-gcc6.2.0 jest dostępna wraz z uruchomieniem środowiska Beast 2.5.1.


Program posiada również graficzny interfejs użytkownika.

Zobacz: jak korzystać z NoMachine.

Tutorial

Dokumentacja



Na górę strony