Beast

Z KdmWiki
Skocz do: nawigacji, wyszukiwania

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Beast

Beast
beast.png
Serwer Wersja
Bem 2.5.1
Kontakt
kdm@wcss.pl


Beast - program do Bayesowskiej analizy filogenetycznej sekwencji molekularnych, jest opracowywany przez zespół naukowców z całego świata.


Licencja

Program jest udostępniany na licencji GNU Lesser General Public License.

Korzystanie w WCSS

Beast dostępny jest na klastrze Bem w katalogu /usr/local/beast/ w wersji 2.5.1.

/usr/local/beast/
`-- 2.5.1/
    `-- with_jre1.8.0_161/
        |-- LICENSE.txt
        |-- README.txt
        |-- VERSION\ HISTORY.txt
        |-- bin/
        |-- examples/
        |-- images/
        |-- jre1.8.0_161/
        |-- lib/
        `-- templates/

Środowisko

Środowisko programu należy uruchomić wykonując polecenie:

> module load beast/2.5.1-with_JRE

lub w skrócie:

> module load beast

Jak korzystać

Lista dostępnych opcji:

> beast -help

Beast2 używa formatu wejściowego XML.

Beast2 jest kompatybilny z bibliotekami beagle-lib, które również są dostępne na klastrze Bem.

Biblioteka beagle/3.0.2-gcc6.2.0 jest dostępna wraz z uruchomieniem środowiska Beast 2.5.1.


Program posiada również graficzny interfejs użytkownika.

Zobacz: jak korzystać z NoMachine.

Tutorial

Dokumentacja



Na górę strony