< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe
| AutoDock | |
|---|---|
| Serwer | Wersja |
| Supernova | 4.2.3 |
| Programy | |
| AutoDock, AutoGrid | |
AutoDock - aplikacja służąca do przewidywania sposobu wiązania się ligandów do receptora o znanej strukturze przestrzennej.
Pakiet udostępniany jest na wolnej licencji GNU GPL. Opis funkcjonalności znajduje się na stronie domowej projektu: AutoDock.
AutoDock jest aplikacją sekwencyjną.
Obliczenia uruchamia się poleceniem:
> sub-autogrid <plik.gpf> [kolejka] > sub-autodock <plik.dpf> [kolejka]
np.
> sub-autogrid test.gpf normal > sub-autodock test.dpf normal
Zobacz też:
| Oprogramowanie naukowe |
Abaqus ⋅ ABINIT ⋅ Accelrys [ MS, DS ] ⋅ ADF ⋅ Amber ⋅ ANSYS ⋅ ANSYS Fluent ⋅ ANSYS CFX ⋅ APBS ⋅ AutoDock ⋅ AutoDock Vina ⋅ Cfour ⋅ CPMD ⋅ CRYSTAL09 ⋅ Dalton ⋅ FDS-SMV ⋅ GAMESS ⋅ Gaussian ⋅ Gromacs ⋅ Hmmer ⋅ LAMMPS ⋅ Mathematica⋅ Matlab ⋅ Meep ⋅ Molcas ⋅ Molden ⋅ Molpro ⋅ MOPAC ⋅ NAMD ⋅ NWChem ⋅ OpenFOAM ⋅ Orca ⋅ Pro/ENGINEER ⋅ R ⋅ SIESTA ⋅ Tripos Sybyl ⋅ TURBOMOLE ⋅ Xaim |
|---|